Учёные определили структуру малоизученного цианофага с высоким разрешением
Исследовательская группа из Гонконгского университета науки и технологий (HKUST) определила структуру с высоким разрешением малоизученного вируса — цианофага P-SCSP1u. Это улучшает понимание вирусной инфекции и может помочь в более точных прогнозах изменения климата. Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.
Метод и ключевые результаты
- С помощью метода криоэлектронной микроскопии одиночных частиц (cryo-EM) учёные получили изображения вируса в его нативной форме с почти атомарным разрешением.
- Были изучены механизм сборки головки вируса и молекулярное взаимодействие в портально-хвостовом комплексе, который контролирует ДНК вируса.
- В сравнении с известной структурой фага T7, исследование показало, как эти вирусы управляют своей ДНК.
- Обнаружены два новых структурных элемента — клапан и ворота, — которые помогают вирусу контролировать ввод и вывод ДНК.
Значение цианофагов
Цианофаги — это вирусы, поражающие цианобактерии. Эти фотосинтезирующие бактерии играют ключевую роль в экосистемах Земли:
- Влияние на углеродный цикл: В освещённых водах около 5% цианобактерий заражены фагами. Инфицированные бактерии превращаются в «фабрики» по производству вирусов.
- Прекращение фиксации CO2: Вирусы могут останавливать способность бактерий использовать CO2, что приводит к ежегодной потере огромного количества углерода — больше, чем производят все коралловые рифы, марши и морские растения на Земле.
- Прогноз климата: Поскольку цианофаги — основная причина гибели цианобактерий, изучение их инфекционного процесса важно для понимания регуляции популяций бактерий. Это критически для точной оценки глобального углеродного бюджета и прогнозирования изменения климата.
Практические перспективы
Понимание механизма заражения может в будущем помочь:
- Использовать вирусы для контроля вредоносного цветения цианобактерий в пресной воде.
- Решать проблемы в аквакультуре и обеспечении чистоты питьевой воды.
Будущие планы исследования
Часть фибриллярной структуры вируса осталась неразрешённой из-за её высокой гибкости, хотя она важна для распознавания и заражения хозяина. Команда планирует имитировать процесс заражения и определить серию структур, чтобы лучше понять весь процесс и выяснить структуру всей фибриллы.
