Полная геномная последовательность плодовой мушки Drosophila mauritiana

Впервые в Ветеринарном университете Вены определили полную геномную последовательность эукариотического организма — плодовой мушки Drosophila mauritiana. Результаты, опубликованные в журнале Genome Research, раскрывают интригующие детали об эволюции этого вида.

Drosophila mauritiana — близкий родственник известной Drosophila melanogaster, но встречается только на острове Маврикий. Ожидалось, что из-за ограниченного ареала генетическое разнообразие вида будет низким.

Однако исследование группы Кристиана Шлёттерера с участией Виолы Нольте показало обратное: геном D. mauritiana оказался высокодиверсифицированным, с полиморфизмами по всем хромосомам.

Ключевое открытие: полиморфизмы распределены неравномерно. Внутри высоковариабельных регионов обнаружены два крупных участка с крайне низкой изменчивостью — «провалы в вариабельности».

Такие «провалы» обычно являются результатом селективных свипов: новые мутации, дающие большое преимущество, быстро распространяются и фиксируются в популяции.

Гипотеза: эти участки могли возникнуть в результате внутригеномного конфликта. В такой модели один ген кодирует «яд», а соседний — устойчивость к нему, что обеспечивает преимущественное наследование определённых аллелей.

Один из двух «провалов» содержит ген Odysseus, который, как предполагалось ранее, участвует в геномном конфликте у родственного вида Drosophila simulans. Второй участок может быть связан с другой подобной системой.

Эти гены, участвующие во внутригеномных конфликтах, могут косвенно поддерживать видовую идентичность, действуя против гибридов с родственными видами, и выступать в роли «видообразующих генов».