Создание набора дрожжевых штаммов для гиперпродукции ключевых клеточных "кирпичиков"

Микробы, такие как бактерии и дрожжи, всё чаще используются для производства компонентов лекарств, биотоплива и продуктов питания. Пекарские дрожжи (Saccharomyces cerevisiae) применяются не только в пивоварении и хлебопечении, но и в промышленных масштабах для получения других ценных молекул.

Использование микробов может стать ключом к более устойчивому производству, но многое в формировании и поддержании микробных сообществ, особенно дрожжевых, остаётся непонятным.

Исследователи из Имперского колледжа Лондона создали молекулярный "набор инструментов" с новым подходом к производству полезных соединений. Работа опубликована в журнале Nature Microbiology.

Суть метода:

  • Набор состоит из 15 различных дрожжевых штаммов.
  • Штаммы гиперпродуцируют ключевые клеточные "кирпичики" — аминокислоты и нуклеотиды — но лишены способности синтезировать другие.
  • В отличие от традиционных синтетических биологических сообществ, штаммы разделены на «доноров» (отдают строительные блоки) и «реципиентов» (получают их).

Тестирование на ресвератроле:

Для проверки системы исследователи изучили её эффективность на примере производства ресвератрола — антиоксиданта из красного вина, изучаемого на предмет потенциальных лечебных свойств.

  • Путь синтеза ресвератрола был разделён между двумя штаммами (донором и реципиентом).
  • В качестве контроля ресвератрол производили стандартным методом с использованием одного штамма.
  • Изучалось влияние добавления питательных веществ, изменения начального соотношения штаммов и плотности клеток.

Результаты:

  • Разделение пути синтеза между двумя штаммами привело к усиленной продукции ресвератрола по сравнению с традиционной платформой.
  • Математическое моделирование показало, что система также позволяет создавать более стабильные и специфичные партнёрства между штаммами дрожжей.

Значение и перспективы:

  • Д-р Родриго Ледесма-Амаро: «Наши выводы, если они будут воспроизведены на других дрожжах и метаболитах, могут значительно повлиять на то, как мы понимаем и используем микробные сообщества в устойчивом биопроизводстве — от еды до биотоплива».
  • Новая система позволяет создавать различные комбинации дрожжевых сообществ для более эффективного и устойчивого производства множества продуктов.
  • Повышение эффективности может привести к уменьшению отходов, снижению энергопотребления и затрат на производство ценных соединений (фармацевтика, продукты питания, напитки, биопластики, биотопливо).

Дальнейшие шаги:

  • Усовершенствование набора и расширение его охвата для работы с более широким спектром малых молекул.
  • Длительные испытания для оценки стабильности системы, что важно для практического применения.
  • Введение других типов дрожжей и мониторинг мутаций и адаптаций.