Улучшен метод идентификации водных видов с помощью eDNA
Исследователи усовершенствовали метод отслеживания видов, используя биологический материал, который организмы оставляют в окружающей среде — так называемую экологическую ДНК (eDNA). Ранее считалось, что ДНК, выделяемая организмами в водной среде, сильно деградирована и имеет низкое качество.
Оказалось, что клетки, которые рыбы выделяют в воду, защищают туго скрученную ДНК. Учёным удалось обнаружить и работать с длинными, неповреждёнными фрагментами ДНК, что меняет прежнее представление о возможности работы только с короткими фрагментами.
Как это работает:
- Исследователи собирали пробы воды из озёр, прудов и ручьёв.
- С помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) амплифицировали (копировали) целые митохондриальные геномы из eDNA, найденной в этих средах.
Значение метода:
- Более точная идентификация: Позволяет точнее определять виды и обнаруживать генетические вариации внутри видов.
- Оценка биоразнообразия: Даёт более детальную картину биоразнообразия в различных водных средах обитания.
- Эффективность: Метод более эффективен для поиска и контроля инвазивных видов.
- Пополнение баз данных: Помогает пополнять базы данных, такие как GenBank Национального центра биотехнологической информации (NCBI), которые критически важны для идентификации видов.
Исследование опубликовано в журнале Methods in Ecology and Evolution.