Секреты генома кораллового рифа раскрыты

Ученые из Австралии впервые полностью расшифровали геном коралла Acropora millepora (рогатый коралл), который является ключевым компонентом Большого Барьерного рифа и рифов по всему миру.

Это первый проект по секвенированию генома животного, полностью выполненный в Австралии. В исследовании участвовали специалисты из Центра передового опыта по изучению коралловых рифов ARC (CoECRS) и Австралийского центра исследований генома (AGRF).

Кораллы образуют основу Большого Барьерного рифа, но находятся под угрозой из-за изменения климата, загрязнения и болезней. Расшифровка генома имеет как практическое, так и научное значение для понимания того, как кораллы строят рифы и почему этот процесс нарушается под воздействием стресса.

Исследование показало, что ДНК кораллов неожиданно сложна. Коралл Acropora millepora имеет примерно такое же количество генов, как и человек, и многие из них remarkably похожи на человеческие.

Геном, состоящий из 28 хромосом и примерно 400 миллионов "букв" ДНК, был секвенирован с использованием технологии Illumina — одного из методов секвенирования нового поколения. Основными сложностями были сборка генома из множества коротких последовательностей и высокий уровень полиморфизма: два гаплотипа генома (от отца и от матери) у кораллов более различны, чем у других видов животных. Для решения этих задач ученым пришлось разработать ряд новых методов сборки генома.

Первый черновой вариант сборки генома Acropora millepora доступен научному сообществу на определенных условиях. Эта работа открывает возможности для значительного прогресса в изучении биологии кораллов, включая их реакцию на изменение климата, закисление океана и другие угрозы.