Геномное исследование нацелено на вредителя фруктов

Геном пятнистокрылой дрозофилы (Drosophila suzukii), опасного вредителя ягод и косточковых культур в США, Канаде и Европе, был секвенирован исследователями из Калифорнийского университета в Дэвисе. Результаты, официально опубликованные 1 декабря в журнале G3 (Genes, Genomics, Genetics), уже доступны в открытом доступе и размещены на общедоступном веб-портале SpottedWingFlyBase, созданном в Университете штата Орегон.

Цель и значение работы:

  • Получение высококачественной референсной последовательности генома для ускорения фундаментальных и прикладных исследований.
  • Разработка более эффективных стратегий мониторинга и контроля вредителя.

О вредителе:

  • Пятнистокрылая дрозофила — мушка уксусная родом из Азии, впервые обнаружена в США в 2008 году.
  • Откладывает яйца внутрь спелых или созревающих плодов (черника, вишня, малина, ежевика), а развивающиеся личинки питаются мякотью, нанося ущерб урожаю.
  • Самцы отличаются характерным черным пятном на кончике каждого крыла, у самок есть пиловидный яйцеклад для прокалывания плодов.

Исследовательская группа и поддержка:

  • Проект по секвенированию возглавили молекулярный генетик Джоанна Чиу и профессор Дэвид Бегун из Калифорнийского университета в Дэвисе.
  • Работа является частью проекта по биологии и контролю Drosophila suzukii с грантом в $5.8 млн от Инициативы USDA по исследованиям специальных культур.
  • В консорциум вошли ученые из Калифорнийского университета в Дэвисе, Университета штата Орегон, Китайского национального генного банка (BGI-Шэньчжэнь) и Американского музея естественной истории.

Ожидаемые результаты и применение:

  1. Портал SpottedWingFlyBase (уже получивший более 3000 просмотров из 20 стран) позволит исследователям изучать биологию вредителя, его пищевые предпочтения, устойчивость к пестицидам.
  2. Геномные данные могут помочь в разработке видов-специфичных методов борьбы.
  3. Определение уникальной генетической сигнатуры вредителя позволит использовать ДНК-тесты для проверки экспортируемых фруктов на наличие личинок, что успокоит страны-импортеры.

Как отметил профессор Фрэнк Залом, ведущий исследователь UC Davis по проекту, представленная работа закладывает основу для будущих геномных исследований Drosophila suzukii, включая изучение детоксикации инсектицидов и рецепции одорантов.