Геномный анализ предсказывает риск вымирания видов

Исследование, проведенное San Diego Zoo Wildlife Alliance и Калифорнийским университетом в Санта-Круз, показало, что геномная информация позволяет прогнозировать риск вымирания млекопитающих.

Ключевой вывод: Виды с исторически меньшей численностью популяции несут больше вредных мутаций и имеют повышенный риск исчезновения. Это указывает, что долгосрочная демографическая история влияет на современный природоохранный статус и устойчивость вида.

Контекст: В условиях быстрой утраты биоразнообразия идентификация видов, нуждающихся в срочной помощи, — долгий и дорогой процесс. Для тысяч видов данных недостаточно.

Метод: Ученые проанализировали геномы 240 видов млекопитающих — от землероек до жирафов, косаток и человека. Они обнаружили, что данные одного генома (отражающие миллионы лет истории вида) позволяют провести быструю и экономичную оценку риска, даже при отсутствии информации о численности, поведении или физиологии.

"Генетическая информация, даже от одной особи, дает конкретные рекомендации для разработки стратегий сохранения", — Арин П. Уайлдер, соавтор исследования.

Практическое применение: На основе геномных данных (демография, разнообразие, вредные мутации) были обучены модели, различающие угрожаемые и неугрожаемые виды. Это позволяет проводить геномный триаж и направлять ограниченные ресурсы на виды с самым высоким риском.

Примеры: Модели успешно оценили риск для видов с дефицитом данных, таких как слепой землекоп Верхней Галилеи, малый канчиль и косатка.

Значимость: Это крупнейшее исследование такого рода. Авторы призывают включить геномную информацию в оценку природоохранного статуса видов, чтобы закрыть разрыв между генетиками и защитниками природы.

"Наши результаты показывают, что одного генома достаточно, чтобы выявить наиболее угрожаемые виды среди тех, по которым 'данных недостаточно'", — Бет Шапиро, соавтор.

Источник данных: Многие образцы для анализа ДНК предоставил "Замороженный зоопарк" (Frozen Zoo) San Diego Zoo Wildlife Alliance — крупнейшее в мире хранилище генетического материала, содержащее клеточные культуры от ~10 000 животных (более 1100 видов).

Исследование является частью работы Консорциума Zoonomia и будет опубликовано в специальном выпуске журнала Science.