Впервые секвенированы геномы 25 видов из Великобритании

Ученые из Института Сэнгера и их коллеги впервые прочитали геномы 25 видов, обитающих в Великобритании. Эти 25 полных геномных последовательностей, объявленные 4 октября в 25-ю годовщину института, позволят в будущем изучать биоразнообразие страны и помогут в сохранении и понимании видов.

Новые геномы позволят исследовать, почему одни популяции кумжи мигрируют в открытый океан, а другие — нет, или изучить магниторецепторы в глазах малиновки, позволяющие им «видеть» магнитное поле Земли. Геномы также могут пролить свет на то, почему рыжие белки уязвимы к вирусу беличьей оспы, в то время как серые белки могут переносить и распространять вирус, не заболевая.

Институт Сэнгера был основан в 1993 году профессором сэром Джоном Салстоном в рамках проекта «Геном человека». Институт внес крупнейший вклад в создание «золотого стандарта» последовательности первого генома человека, опубликованного в 2003 году.

Геном — это полный набор генетических инструкций организма, записанный в ДНК. Каждый геном содержит всю информацию, необходимую для построения организма и его развития.

С момента знакового завершения проекта «Геном человека» Институт Сэнгера стал всемирно признанным лидером в области геномики. Было секвенировано множество других важных референсных геномов — от мыши и рыбки данио до свиньи, гориллы, комара и многих других. Помимо животных, в списке референсных геномов значительное место занимают возбудители инфекционных заболеваний и бактерии — от сальмонеллы и MRSA до хламидии и малярии. Все они дали важные сведения об этих видах в контексте здоровья и болезней.

Теперь Институт Сэнгера и его партнеры впервые комплексно секвенировали 25 видов из Великобритании. Первый геном человека потребовал 13 лет и миллиардов долларов. Благодаря огромному прогрессу в технологиях и снижению стоимости секвенирования ученые смогли заново секвенировать геномы 25 видов менее чем за год и за гораздо меньшую стоимость.

Доктор Джулия Уилсон, заместитель директора Института Сэнгера, заявила: «Мы рады объявить о завершении работы над 25 геномами видов из Великобритании. Секвенирование этих видов впервые не обошлось без трудностей, но наши ученые и сотрудники неоднократно находили инновационные решения для их преодоления».

Координатор проекта «25 геномов» Дэн Мид отметил: «Мы уже обнаруживаем удивительные секреты, которые эти виды хранят в своих геномах. Мы выяснили, что генетическое разнообразие гребешков больше, чем у людей, а геном певчего кузнечика в четыре раза больше человеческого».

Проект стал возможным благодаря технологии длинного чтения PacBio, которая генерирует высококачественные геномы. Институт сотрудничал с PacBio и другими лидерами технологического сектора — 10x Genomics и Illumina — для создания наиболее полной картины этих геномов.

Высококачественные геномы будут бесплатно доступны ученым для исследований. Исследователи смогут выяснить, как виды в Великобритании реагируют на давление окружающей среды и какие генетические секреты позволяют им процветать или приходить в упадок.

Доктор Тим Литтлвуд, руководитель отдела наук о жизни в Музее естественной истории в Лондоне и партнер проекта, сказал: «Проект "25 геномов" раскрыл "чертежи" разнообразной жизни Великобритании, что фактически перепишет наши знания об этих видах».

Этот проект — небольшой вклад в гораздо более масштабную задачу, в рамках которой ученые со всего мира объединяются, чтобы составить план по секвенированию всей жизни на Земле.

Профессор сэр Майк Страттон, директор Института Сэнгера, сказал: «Технология секвенирования ДНК за последние годы продвинулась до такой точки, что мы можем, по крайней мере, обсуждать возможность секвенирования геномов всей жизни на Земле».