Биологи раскрыли механизм регуляции экспрессии генов в зрительной системе

Биологи обнаружили ключевой механизм регуляции, используемый для экспрессии генов в зрительной системе. Результаты исследования, опубликованные в журнале Cell, проливают свет на сложность генетической организации биологических систем.

Исследование, проведенное учеными из Нью-Йоркского университета, Университета Окаямы (Япония), Детской больницы Цинциннати и Университета Вюрцбурга (Германия), было сосредоточено на фоторецепторных клетках сетчатки плодовой мушки Drosophila. Drosophila — мощная модель для изучения развития глаза, позволяющая проводить специфические генетические манипуляции.

Хотя ученые определили функции многих генов, взаимодействие между ними изучено плохо, особенно в таком сложном органе, как глаз. Например, в глазу Drosophila паттерны экспрессии родопсинов — светочувствительных белков сетчатки — определяют как минимум 13 различных типов фоторецепторов.

Целью работы было понять, как гены взаимодействуют по-разному в разных клетках, образуя сети для контроля точных паттернов экспрессии генов родопсина.

В ходе исследования был идентифицирован ген, являющийся критическим узлом в этой сети — defective proventriculus (dve). Он регулирует экспрессию нескольких генов родопсина в зрительной системе. Ученые сравнили нормальные и мутантные системы.

Ключевые находки:

  • В мутантах по гену dve родопсины, характерные для фоторецепторов цветового зрения, начинают экспрессироваться в фоторецепторах, отвечающих за обнаружение движения.
  • Эта мутация вызывает дефекты в обнаружении света, особенно при восприятии тонких различий в уровне освещенности.

Механизм регуляции:

Ген dve является общим компонентом двух противоположных, сцепленных петлей прямой связи (FFL), которые служат критическими сетевыми мотивами, контролирующими экспрессию генов.

  1. В одной FFL белок Dve подавляет экспрессию родопсина в фоторецепторах движения.
  2. В фоторецепторах цветового зрения вторая FFL снимает репрессию, опосредованную Dve, и одновременно активирует экспрессию родопсина.

Таким образом, эта сеть одновременно ограничивает и индуцирует экспрессию, специфичную для типа клеток. Исследователи пришли к выводу, что такая сцепленная FFL может быть общим механизмом контроля экспрессии генов.

"Мы знаем, что гены работают в комбинациях, но согласованность взаимодействий между типами клеток изучена плохо. Мы показываем, как эти сети функционируют в нескольких различных типах клеток — этот механизм гарантирует, что родопсины находятся в правильных клетках", — пояснил соавтор исследования Роберт Джонстон.