Современные технологии делают идентификацию видов интерактивной
Род паразитических ос, важных для биоконтроля вредителей-плодовых мух, остаётся малоизученным. Последний определительный ключ для него был создан в 1969 году, а с тех пор было описано много новых видов. Более того, эта группа морфологически сходных видов, вероятно, содержит ещё множество неописанных видов.
Изучив видовую группу этих ос в Центральной Европе, учёные Фабиан Климмек и Ханнес Баур из Музея естественной истории Берна (Швейцария) не только показали необходимость обновления знаний, но и продемонстрировали преимущества современного таксономического ПО, способного анализировать большие объёмы описательных и количественных данных.
В статье, опубликованной в открытом журнале Biodiversity Data Journal, команда описывает новый вид — Pteromalus capito — и представляет обсуждение бесплатного программного обеспечения Xper3, разработанного Лабораторией информатики и систематики Университета Пьера и Марии Кюри. С помощью этого ПО был создан общедоступный обновлённый ключ для видовой группы Pteromalus albipennis.
Полностью иллюстрированная интерактивная база данных охватывает 27 видов этой группы и 18 родственных видов, а также включает полную диагнозную таблицу, большой набор морфометрических данных и 585 изображений, демонстрирующих большинство характерных признаков для каждого вида.
«Современные компьютерные технологии, методы и оборудование для измерений позволяют использовать более сложные способы включения количественных признаков, что значительно улучшает разграничение криптических видов», — поясняют учёные.
«Недавно разработанное ПО для создания биологических определительных ключей, такое как Xper3, Lucid или Delta, может иметь потенциал для замены традиционных бумажных ключей».
В качестве примера авторы приводят один из изученных видов ос: его идентификация по старому ключу требовала 16 шагов, тогда как с интерактивной альтернативой потребовалось всего 6 шагов.
Эффективность инструментов вроде Xper3 отчасти объясняется тем, что автор ключа может расположить все описательные признаки в определённом порядке и придать им разный вес при определении вида. При попытке идентифицировать экземпляр программа сначала проверяет признаки с наивысшим приоритетом, чтобы исключить неподходящие таксоны и предоставить список оставшихся названий. Если вариантов остаётся несколько, проверка продолжается по следующим признакам, пока не останется единственное название, которое должно соответствовать образцу. На любом этапе исследователь может проверить хронологию выбора, чтобы выявить потенциальные несоответствия, не прерывая процесс.
Интерактивные определительные ключи как продукт цифрового ПО не только легко, быстро и дёшево публиковать, но их также просто редактировать и развивать совместными усилиями. Эксперты со всего мира могут обновлять ключ, если автор предоставит им соответствующие права. При этом, независимо от количества обновлений, постоянная URL-ссылка всегда будет вести к последней версии.
Чтобы обеспечить долгосрочную доступность ключа и исходных данных, учёные загрузили все исходные файлы данных, R-скрипты, фотографии, списки и данные о подготовленных образцах в исследовательский архив Zenodo, созданный OpenAIRE и CERN.