Расшифрован геном короткоживущей рыбки киллифиш для изучения генетики долголетия

Исследователи из Стэнфордского университета составили карту генома африканской бирюзовой киллифиш — рыбы с необычно короткой продолжительностью жизни. Это открывает путь для изучения того, как гены влияют на долголетие. Геном и первые данные о генетических детерминантах срока жизни будут опубликованы 3 декабря в журнале Cell.

• Эволюционный ключ: Статистический анализ скорости мутаций у разных организмов показал, что некоторые редкие гены, сохранившиеся в генофонде киллифиш на протяжении веков, также присутствуют у некоторых необычно долгоживущих животных. Это позволяет предположить, что эволюция могла «настраивать» определенные гены для создания разной продолжительности жизни.
• Модельный организм: Киллифиш эволюционировала, чтобы вылупляться и размножаться в течение коротких сезонов дождей в Мозамбике и Зимбабве. Некоторые штаммы живут всего 4–6 месяцев. Сравнение с видами, живущими до 200 лет (как некоторые киты), может дать представление об огромном диапазоне сроков жизни в природе и, возможно, о различиях среди людей.
• Метод и находки: Ученые секвенировали и собрали полный цифровой каркас генома, а также выявили генетические вариации внутри вида. При скрещивании короткоживущих рыб с долгоживущим штаммом был обнаружен кластер генов, связанных с долголетием, который передавался от долгоживущих бабушек и дедушек к внукам. Некоторые из этих генов ассоциированы со старением у других видов.
• Связь с человеком: Один из этих генов у киллифиш является эквивалентом человеческого гена, мутация в котором связана с лобно-височной деменцией, болезнью, проявляющейся в позднем взрослом возрасте. Это указывает на потенциальную релевантность модели для здоровья человека.
• Ресурс для сообщества: Чтобы сделать киллифиш общепризнанной моделью, исследователи создали бесплатный онлайн-ресурс — http://africanturquoisekillifishbrowser.org, где ученые могут искать интересующие их гены. В том же выпуске Cell будет опубликована еще одна работа по геному киллифиш от немецкой команды, что, как надеются авторы, выведет исследования долголетия на этом организме на новый уровень.