Атлас клеток открывает новые возможности в биомедицинских исследованиях
Исследователи из Каролинского института разработали веб-платформу, которая предоставляет беспрецедентный взгляд на человеческий организм на клеточном уровне. Цель — создать бесценный ресурс для учёных по всему миру для углубления знаний о здоровье и болезнях человека. Исследование опубликовано в Genome Biology.
Одновременное измерение множества биомолекулярных переменных, известное как мульти-омикс, позволяет проводить глубокий и всесторонний анализ человеческой биологии. Новый Атлас одиночных клеток (Single Cell Atlas, SCA) основан на анализе тысяч образцов человеческих тканей из 125 различных тканей взрослого организма и плода. Исследователи объединили восемь передовых омикс-технологий, включая секвенирование РНК единичных клеток, полногеномное секвенирование и пространственную транскриптомику, чтобы картировать и локализовать гены, экспрессируемые в ткани.
Прокладывая путь к новым открытиям
Платформа предоставляет уникальное представление о свойствах отдельных клеток и их взаимодействиях внутри тканей. Обширная коллекция данных находится в свободном доступе через сайт платформы.
«Атлас одиночных клеток не только экономит время и ресурсы, но и способствует созданию совместной среды для учёных из разных областей, прокладывая путь к новым открытиям и инновациям», — говорит Лу Пан, исследователь из Института экологической медицины Каролинского института и первый автор исследования.
В перспективе команда планирует усовершенствовать SCA, вводя более детальные анализы и ежегодные обновления. Эти улучшения заполнят пробелы в представленности тканей и увеличат размер выборки, что позволит проводить более точные исследования.
«Создание SCA знаменует собой значительный шаг вперёд в биомедицинских исследованиях», — говорит Сюэсинь Ли, исследователь с кафедры физиологии и фармакологии (ранее — кафедры медицинской биохимии и биофизики) Каролинского института. «Наша цель — постоянно обогащать атлас, делая его бесценным ресурсом для понимания здоровья и болезней человека».