Расслабление нитей ДНК с помощью наноканалов

Простой и эффективный способ распутать часто запутанную массу ДНК — «протянуть» нить в наноканал. Исследование с участием Международной школы перспективных исследований в Триесте использовало моделирование для измерения характеристик, которыми должен обладать такой канал для достижения максимальной эффективности.

С распространением методов анализа и манипуляции ДНК, безусловно, полезно найти способ распутать и расслабить нити этой молекулы, которая имеет тенденцию к спонтанному образованию узлов. Один из способов — использовать каналы, точнее наноканалы, как это сделали научный сотрудник SISSA Кристиан Микелетти и Энцо Орландини из Университета Падуи в исследовании, только что опубликованном в журнале Macro Letters.

Идея заключается в том, чтобы заставить ДНК войти в канал и полностью расслабиться. «Но не любой канал подойдет», — объясняет Микелетти. «В зависимости от диаметра наноканала концевые участки нити могут формировать крючкообразные структуры, которые в итоге образуют узел».

«В нашем исследовании мы использовали методы моделирования, чтобы охарактеризовать механизмы, ведущие к образованию узлов, в зависимости от диаметра канала», — продолжает Микелетти.