Общие гены с родственниками-неандертальцами — не редкость

В ходе эволюции наши предки скрещивались с неандертальцами, а также с другими родственными гоминидами. В этом недельном онлайн-выпуске PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences) исследователи из Уппсальского университета публикуют данные, показывающие, что люди в Восточной Азии имеют общий генетический материал с денисовцами, получившими название от пещеры в Сибири, где они были впервые обнаружены.

"Наше исследование охватывает большую часть мира, чем предыдущие, и ясно, что всё не так просто, как мы думали ранее. Гибридизация происходила в нескольких точках эволюции, и её генетические следы можно найти в нескольких местах мира. Мы, вероятно, обнаружим больше подобных событий", — говорит Маттиас Якобссон, проводивший исследование вместе с Понтусом Скоглундом.

Предыдущие исследования обнаружили два отдельных события гибридизации между так называемыми архаичными людьми (отличающимися от современных людей как генетически, так и морфологически) и предками современных людей после их исхода из Африки:

  • гибридизация между неандертальцами и предками современных людей за пределами Африки;
  • гибридизация между денисовцами и предками коренных народов Океании.

Генетическая разница между неандертальцами и денисовцами примерно так же велика, как максимальный уровень вариаций среди нас, современных людей.

Исследование шведских учёных демонстрирует, что гибридизация также происходила на материковой части Восточной Азии. Связь была обнаружена с использованием генотипных данных для получения большего набора данных. Полные геномы современных людей доступны лишь для нескольких десятков индивидов, тогда как генотипные данные есть для тысяч людей. Эти генетические данные можно сравнить с последовательностями геномов неандертальцев и денисовца, определёнными из археологического материала (от последнего описаны только кость мизинца и зуб).

Генотипные данные получены в результате генетических исследований, где сотни тысяч генетических вариантов собираются на чипе. Однако этот процесс приводит к тому, что необычные варианты не включаются, что может вызвать смещения, если материал рассматривать как полные геномы. Скоглунд и Якобссон использовали сложные компьютерные симуляции, чтобы определить, что означает этот источник ошибки для сравнений с архаичными генами, и смогли использовать генетические данные более чем от 1500 современных людей со всего мира.

"Мы обнаружили, что индивиды в основном из Юго-Восточной Азии имеют более высокую долю генетических вариантов, связанных с денисовцами, чем люди из других частей мира, таких как Европа, Америка, Западная и Центральная Азия и Африка. Результаты показывают, что поток генов от архаичных человеческих групп также происходил на азиатском материке", — говорит Маттиас Якобссон.

"Хотя мы видим, что генетический материал архаичных людей сохраняется в большей степени, чем считалось ранее, мы всё ещё очень мало знаем об истории этих групп и о том, когда происходили их контакты с современными людьми", — говорит Понтус Скоглунд.

Поскольку они находят денисовские генетические варианты в Юго-Восточной Азии и Океании, но не в Европе и Америке, исследователи предполагают, что гибридизация с денисовским человеком произошла около 20 000 лет назад, но могла случиться и раньше. Это произошло задолго после того, как ветвь, ставшая современными людьми, отделилась от ветви, ведущей к неандертальцам и денисовцам, примерно 300 000–500 000 лет назад.

"С более полными геномами современных людей и большим количеством анализов ископаемого материала можно будет описать нашу предысторию с гораздо большей точностью и детализацией", — говорит Маттиас Якобссон.