Синяя болезнь хлопчатника в США идентифицирована с помощью секвенирования нового поколения

Синяя болезнь хлопчатника, вызываемая вирусом карликовости листьев хлопчатника (Cotton leafroll dwarf virus, CLRDV), была впервые зарегистрирована в 1949 году в Центральноафриканской Республике, а затем повторно — только в 2005 году в Бразилии. В 2017 году болезнь была выявлена в Алабаме, что стало первым случаем в США.

Фитопатологи обнаружили деформацию листвы, скручивание и закатывание листьев у хлопчатника в шести округах прибрежной Алабамы. Образцы были отправлены фитопатологу из Университета Аризоны Джудит К. Браун, которая изначально предполагала, что возбудителем является геминивирус, переносимый белокрылкой — единственный известный на тот момент тип вируса, поражающий хлопчатник в США. Однако после использования платформы Illumina для геномных исследований и проведения секвенирования нового поколения Браун установила, что симптомы характерны для синей болезни хлопчатника.

Характерные симптомы включают замедление роста растений и потерю хлорофилла, что приводит к пожелтению или карликовости пораженных листьев и/или всего растения. Болезнь также подавляет транспорт веществ и вызывает покраснение из-за дефицита питательных элементов. Симптомы обычно проявляются только после полного цветения в конце августа.

Для изучения методов борьбы с болезнью Браун исследовала стратегии управления, применяемые в Бразилии. Там стратегии сосредоточены на уничтожении растения-резервуара с помощью борьбы с сорняками и предотвращении роста падалицы хлопчатника; последнее не является проблемой в Алабаме, где земля промерзает. В Бразилии для контроля насекомых-переносчиков болезни используются химикаты, но этот вариант неприменим в США. В настоящее время не существует рекомендованного курса управления синей болезнью хлопчатника. Необходимы дополнительные исследования для определения эффективных стратегий. Браун призывает исследователей сосредоточиться на генетической устойчивости.

Полная история открытия синей болезни хлопчатника в Алабаме представлена в двух веб-трансляциях "Focus on Cotton":

• 33-минутная "Introduction of Cotton leaf roll dwarf-like Polerovirus into the United States: High-Throughput Discovery, Identification, and Genomic Comparisons" Джудит К. Браун.
• 13-минутная "Cotton Blue Disease Caused by Cotton leafroll dwarf like virus: Identification, Symptomology, and Occurrence in Alabama" Кэти С. Лоуренс.

Обе презентации доступны через ресурс "Focus on Cotton" на Plant Management Network. Этот ресурс содержит более 75 веб-трансляций и материалы шести конференций по широкому спектру аспектов управления посевами хлопчатника. Веб-трансляции доступны читателям в открытом доступе (без подписки).

На домашней странице "Focus on Cotton" также можно получить доступ к ресурсу "Cotton Cultivated" от Cotton Incorporated, который помогает быстро найти самую актуальную информацию по производству хлопка. Эти и другие ресурсы предоставляются бесплатно благодаря Cotton Incorporated.