Новые функции пируват-чувствительного белка PdhR в E. coli
Пируват — конечный продукт гликолиза и ключевой узел метаболических путей. Ученые под руководством доктора Томохиро Шимады из Университета Мэйдзи исследовали белок PdhR, главный регулятор катаболизма пирувата в E. coli.
Используя метод gSELEX (Genomic SELEX), команда идентифицировала 16-27 возможных мишеней PdhR в геноме бактерии. Анализ ранее неизвестных мишеней выявил новые функции регулятора:
- Подвижность: PdhR действует как репрессор генов, влияющих на образование жгутиков — органелл для движения бактерий.
- Метаболизм жирных кислот: PdhR активирует расщепление жирных кислот, подавляя белок-ингибитор этого процесса.
Таким образом, активный PdhR снижает подвижность бактерий и увеличивает деградацию жирных кислот.
Также были обнаружены другие гены углеродного метаболизма, регулируемые PdhR, включая ферменты, участвующие в:
- производстве пирувата в ходе гликолиза,
- метаболизме лактата,
- цикле TCA.
«Наша работа расширила известную роль PdhR. Поскольку активность PdhR зависит от концентрации пирувата, эти результаты помогают лучше понять центральную роль пирувата в метаболизме E. coli», — заключает доктор Шимада.
Открытие новых функций PdhR может найти применение в биоинженерии и помочь в манипулировании метаболизмом E. coli, а также дать insights для более сложных организмов.