Первое частичное секвенирование генома иберийской свиньи

Исследователи из Университета Автономного де Барселона (UAB), Центра исследований в области сельскохозяйственной геномики (CRAG), Центра геномной регуляции (CRG) в Барселоне, Национального института аграрных технологий и исследований в Мадриде и Вагенингенского исследовательского центра (WUR, Нидерланды) впервые опубликовали частичное секвенирование генома иберийской свиньи.

Объект исследования

Секвенирована была иберийская свиноматка линии Guadyerbas. Эта уникальная линия с 1945 года содержится в изоляции на экспериментальной ферме правительства Кастилии-Ла-Манчи в Оропесе (Толедо). Guadyerbas представляет одну из первых оригинальных линий иберийской свиньи в Испании. Эти животные обладают хорошим аппетитом, медленно растут, ожиреют, безволосы и имеют чёрный окрас.

Метод и результаты

С помощью методов секвенирования нового поколения учёные секвенировали и проанализировали 1% генома. Это первая публикация последовательности генома отдельной свиньи.

Несмотря на высокий уровень инбридинга (стадо изолировано более 50 лет), данные секвенирования показали неожиданно высокий уровень генетической изменчивости. Она составляет примерно половину от всей европейской популяции, что важно для сохранения вида и демонстрирует его репрезентативность.

Ключевые генетические особенности

• Высокая изменчивость обнаружена в генах, связанных с обонятельной и иммунной системами.
• Низкая изменчивость наблюдается в генах, отвечающих за метаболизм углеводов.
• Половой X-хромосома оказалась более однородной, чем ожидалось.

Значение и перспективы

Сравнение регионов с высокой и низкой изменчивостью даёт ключи к пониманию генов, наиболее важных с точки зрения отбора у иберийских свиней. Изучение различий между международными мясными породами и иберийскими свиньями поможет понять генетическую уникальность последних, включая их высококачественное мясо.

Полный анализ станет возможен после завершения международным консорциумом полного секвенирования и аннотации референсного генома свиньи, запланированного на конец года.