Проект по секвенированию геномов 40 000 видов растений, животных и грибов на каталаноязычных территориях
Быстрая и прогрессирующая потеря биоразнообразия — некоторые эксперты говорят о шестом массовом вымирании — создает серьезный дисбаланс в экосистемах. Цель международного проекта Earth BioGenome Project (EBP) — секвенировать геномы всех известных видов на Земле (около 2 миллионов) для их защиты.
Каталонская инициатива (Catalan Initiative for the Earth BioGenome Project, CBP) участвует в этом проекте, чтобы секвенировать геномы эукариотических видов на каталаноязычных территориях (Андорра, Северная Каталония, Балеарские острова, Валенсийское сообщество и Княжество Каталония). О проекте сообщается в статье журнала NAR Genomics and Bioinformatics.
Значение секвенирования для защиты видов
Знание генома живых существ критически важно для разработки стратегий по сдерживанию потери биоразнообразия. На каталаноязычных территориях обитает четверть всех известных видов Европы, включая множество эндемиков, которым угрожает изменение климата.
По словам профессора Монтсеррат Короминас (Университет Барселоны, UB), ключевое достижение CBP — объединение ученых из разных биологических дисциплин для междисциплинарных исследований.
Профессор Родерик Гиго (Центр геномной регуляции, CRG) отмечает, что получение геномов всех видов Земли может стать важнейшим проектом в истории науки, с огромным потенциальным влиянием на медицину, сельское хозяйство, биотехнологии и развитие биоэкономики.
Пилотная фаза и первые результаты
В пилотной фазе проекта, начавшейся летом 2020 года, создан оцифрованный каталог видов и запланировано секвенирование геномов 76 видов. Среди них:
- Малоизученные таксоны (пресноводный жгутиконосец Singekia montserratensis).
- Редкие или эндемичные виды (каталонский слепой скорпион Belisarius xambeui).
- Виды, используемые в медицине (пиренейская ромашка Achillea ptarmica subsp. pyrenaica).
- Виды, находящиеся под угрозой исчезновения (тритон Монсеньи Calotriton arnoldi, красный коралл Corallium rubrum).
Одним из первых расшифрованных геномов стал геном балеарского буревестника (Puffinus mauretanicus) — морской птицы, эндемика Балеарских островов, находящегося на грани исчезновения (по данным Международного союза охраны природы, IUCN).
По словам профессоров Марты Рьюторт и Хулио Росаса (UB), полный геном позволил лучше оценить состояние популяций этого вида и разработать инструменты для его сохранения.
Методология и участники
В проекте участвуют около 150 экспертов из ведущих научных центров (UB, CRG, IBE-UPF-CSIC, CNAG и др.). Большинство геномов секвенируется в Национальном центре геномного анализа (CNAG).
«Благодаря развитию технологий мы можем получать высококачественные референсные геномы с невиданной ранее скоростью», — отмечает эксперт CNAG Тайлер Алиото.
Цели и наследие проекта
CBP была учреждена в 2019 году Каталонским обществом биологии (SCB) при поддержке Каталонского института естественной истории (ICHN) и Института каталонских исследований (IEC). С июня 2024 года проект координируют Марта Рьюторт (UB) и Хавьер дель Кампо (IBE).
Цель инициативы — не только научный вклад, но и повышение осведомленности общества об угрозе утраты биоразнообразия, а также укрепление сбалансированных отношений с природой во всем мире.
«Мы надеемся, что по завершении международного проекта сможем сказать, что внесли значительный вклад со своих территорий», — заключают Монтсеррат Короминас и Родерик Гиго.