Новая технология секвенирования раскрывает реальное содержание геномов растений
Команда ученых из Университета Данди и Института Джеймса Хаттона (JHI) впервые в мире применила новую технику для секвенирования генов растения Arabidopsis.
Метод, описанный в журнале Nature Structural & Molecular Biology, позволяет напрямую секвенировать молекулу РНК, а не ДНК. Это помогает точно определить, где заканчиваются гены растения.
Суть метода
Традиционно РНК секвенируют, предварительно превращая её обратно в ДНК, фрагментируя и многократно копируя. Эти этапы вносят ошибки и искажения. Новая технология от Helicos Biosciences позволяет секвенировать РНК напрямую, минуя эти шаги.
Значение открытия
- Точное картирование генов: Метод с беспрецедентной точностью показывает, где заканчиваются гены, помогая найти их в геноме и понять их функцию.
- Понимание поведения клеток: Клетки могут выбирать, где должен закончиться ген, в зависимости от его задачи. Например, это влияет на время цветения растения. Подобные изменения также наблюдаются в раковых тканях.
Ключевые находки
- Обнаружено, что значительную часть генной активности обеспечивают перекрывающиеся друг с другом гены.
- Выявлены новые концы для тысяч генов и обнаружены ранее неизвестные гены.
Перспективы
Прямое секвенирование РНК особенно полезно при работе с малым количеством клеток, например, в образцах пациентов. Технология может быть применена к сельскохозяйственным культурам для ускорения селекции новых сортов.
Исследование финансировалось Советом по биотехнологическим и биологическим исследованиям (BBSRC).