Новый тест для выявления картофельной нематоды

Ученый из Министерства сельского хозяйства США (USDA) разработал новый инструмент в борьбе с картофельной цистообразующей нематодой — диагностический тест, определяющий тип нематоды, поражающей поле.

Сяохун Ван, молекулярный биолог из Исследовательского центра сельского хозяйства и здоровья Роберта У. Холли (ARS) в Итаке, подала заявку на патент на этот инструмент мониторинга. Он был создан, в частности, путем клонирования и секвенирования ключевых генов.

Существует два типа картофельной цистообразующей нематоды (PCN): золотистая нематода и бледная нематода. Их различение критически важно, так как селекционеры вывели сорта картофеля, устойчивые к золотистой нематоде, но еще не создали сортов, устойчивых к бледной нематоде. Если бледная нематода обнаружена в поле, выращивать там картофель нельзя.

Золотистая нематода (Globodera rostochiensis) является проблемой в штате Нью-Йорк с 1941 года и встречается в Канаде. Бледная нематода (G. pallida) была обнаружена в Айдахо в 2006 году и остается серьезной угрозой в Европе. Поскольку картофель и семенной картофель свободно пересекают границы, мониторинг регионов выращивания крайне важен.

Традиционные методы различения двух видов PCN основывались на трудоемком морфологическом анализе и ПЦР-тестах (полимеразная цепная реакция), а также требовали относительно больших образцов цист нематод. Ван и ее коллеги клонировали ген паразитизма, который нематоды используют для производства белка, играющего важную роль в процессе заражения, — хоризматмутазы.

Исследователи секвенировали эти гены хоризматмутазы, сравнили последовательности и идентифицировали уникальные участки в каждой из них. Затем они разработали зонд, способный распознавать уникальные участки в ДНК каждой нематоды. Ван описала этот процесс в статье в European Journal of Plant Pathology.

Этот диагностический тест — один из нескольких новых методов различения типов PCN, но он в тысячу раз чувствительнее других систем. Ожидается, что он найдет широкое применение в регуляторных и карантинных программах, поскольку дает надежные результаты при использовании крошечных количеств материала нематод.