Полногеномное исследование подтверждает шесть подвидов тигров

В дикой природе осталось менее 4000 свободно живущих тигров. Усилия по их защите осложнялись неопределённостью в количестве подвидов: шесть, пять или всего два. Исследователи, проанализировавшие полные геномы 32 репрезентативных особей, подтвердили, что тигры действительно делятся на шесть генетически различных групп. Результаты опубликованы в Current Biology 25 октября.

Эти шесть подвидов включают бенгальского, амурского, южнокитайского, суматранского, индокитайского и малайского тигра, впервые предложенных к выделению в 2004 году. Три других подвида тигра уже вымерли.

Отсутствие консенсуса по количеству подвидов частично мешало глобальным усилиям по спасению вида, поскольку программы разведения в неволе и вмешательство в природные популяции требуют чёткого определения единиц для сохранения. Данное исследование впервые раскрывает естественную историю тигра с полногеномной перспективы, предоставляя надёжные доказательства происхождения и эволюции этого вида.

Учёные использовали полногеномный подход, чтобы расширить предыдущие генетические данные об эволюционной истории и структуре популяций тигра. Такой подход также позволил найти сигналы естественного отбора, благодаря которому разные группы тигров адаптировались к условиям своих географических регионов.

Ископаемые свидетельства указывают на возраст тигров в 2–3 миллиона лет. Однако геномные данные показывают, что все ныне живущие тигры происходят от предка, жившего около 110 000 лет назад, когда вид пережил серьёзное сокращение популяции.

Геномные данные демонстрируют крайне низкий поток генов между популяциями тигров. Несмотря на низкое генетическое разнообразие, структура между группами чётко выражена, что указывает на уникальную эволюционную историю каждого подвида. Это уникальная ситуация среди больших кошек; например, ягуары демонстрируют гораздо большее смешение на континентальном уровне.

Подвиды тигров имеют отличительные черты. Например, амурские тигры крупные со светло-оранжевым мехом, а суматранские тигры с островов Зондского архипелага меньше, с более тёмным и густо полосатым мехом. Исследователям удалось обнаружить свидетельства естественного отбора, несмотря на недавнего общего предка всех тигров.

Самый сильный сигнал отбора был обнаружен у суматранского тигра в геномной области, содержащей ген ADH7, связанный с размером тела. Учёные предполагают, что отбор в сторону меньшего размера мог снизить энергетические потребности, позволив выживать на более мелкой добыче острова, такой как дикие свиньи и мунтжаки (небольшие олени).

Новые данные представляют самые убедительные на сегодня генетические доказательства для разделения тигров на подвиды. «Тигры не все одинаковы. Тигры из России эволюционно отличаются от тигров из Индии. Даже тигры из Малайзии и Индонезии разные».

Происхождение южнокитайского тигра остаётся неразрешённым, поскольку в исследовании использовался лишь один образец из неволи. К сожалению, этот подвид вымер в дикой природе. Исследователи планируют изучить старые образцы из разных регионов Китая, чтобы заполнить пробелы в эволюционной истории тигров, а также получить геномную информацию от исторических образцов вымерших каспийского, яванского и балийского подвидов.