Секвенирование улитковой рыбы из Марианской впадины раскрывает механизмы адаптации к жизни на большой глубине

Международная группа исследователей из Китая изучила улитковую рыбу, обитающую в самых глубоких частях океана. В статье, опубликованной в журнале Nature Ecology and Evolution, учёные описали секвенирование генома этой рыбы и полученные результаты.

Объект исследования: Pseudoliparis swirei — вид улитковой рыбы, обитающей на дне Марианской впадины. Их неофициально называют гадальными улитковыми рыбами, так как они живут в гадальной зоне океана (глубже 6000 метров). Изученные особи жили на глубине около 7000 метров.

Условия среды: Дно Марианской впадины негостеприимно: полная темнота, низкая температура и экстремальное давление. Несмотря на это, там обитает множество существ, включая улитковую рыбу — главного хищника в этой экосистеме.

Методы: Для изучения адаптаций рыбы учёные использовали дистанционно управляемый подводный аппарат, чтобы отловить образцы и поднять их на поверхность. Затем было проведено геномное секвенирование, а результаты сравнили с геномом близкородственного вида улитковых рыб, обитающего в приливных лужах.

Ключевые находки:

• Скелет рыбы состоит из хряща, который гораздо лучше переносит высокое давление, чем кость.
• Гадальная улитковая рыба потеряла часть генома, отвечающую за светочувствительность и, следовательно, зрение. Однако другие гены, связанные со зрением, остались нетронутыми, что позволяет предположить, что рыба всё ещё может видеть.
• Обнаружены изменения в группах генов, участвующих в производстве жирных кислот. Это помогает клеточным мембранам оставаться гибкими на большой глубине.
• Выявлены другие гены, которые, вероятно, изменились, чтобы предотвратить неправильное сворачивание белков под давлением.