Учёные впервые определили атомную структуру нуклеокапсида вируса Эпштейна-Барр
Команда китайских учёных под руководством профессора Юй Сюэкуя из Шанхайского института Materia Medica (SIMM) Китайской академии наук (CAS) и профессора Цзэн Мушэна из Университета Сунь Ятсена представила первую полную атомную модель нуклеокапсида вируса Эпштейна-Барр (EBV). Исследование опубликовано онлайн в журнале Cell Research.
Как и другие герпесвирусы, EBV (член подсемейства Gammaherpesvirinae) имеет характерную трёхслойную структуру: внешнюю липидную оболочку, внутренний нуклеокапсид и промежуточный тегумент. Сборка нуклеокапсида — ключевой этап формирования инфекционной вирусной частицы, поэтому раскрытие её механизма должно помочь в рациональном дизайне противовирусных препаратов.
EBV — первый идентифицированный онковирус и один из важнейших герпесвирусов человека. Он инфицирует более 90% населения мира и тесно связан с различными злокачественными заболеваниями, включая лимфому Ходжкина, лимфому Беркитта, NK/T-клеточную лимфому и назофарингеальную карциному. Несмотря на медицинскую значимость, структурные и функциональные исследования EBV сильно отстают от других герпесвирусов человека (таких как HCMV, HSV и KSHV) из-за сложностей в подготовке образцов.
Разработав новый метод культивирования вируса и используя криоэлектронную микроскопию, учёные получили высококачественный образец EBV.
Затем они определили высокоразрешающую структуру нуклеокапсида EBV и создали его первую полную атомную модель, включающую икосаэдрический капсид, связанный с капсидом тегументный комплекс (CATC) и додекамерную портальную структуру — аппарат для транслокации вирусного генома.
Исследование описало многоуровневые взаимодействия между белками капсида EBV, CATC и капсидом, порталом и капсидом, порталом и вирусным геномом, что дало ключевую структурную основу для разработки противовирусных препаратов.
Кроме того, сравнив структуру нуклеокапсида EBV с аналогами других герпесвирусов, учёные обнаружили, что гибкость пентонов капсида, количество копий и паттерны связывания CATC с вершинами вирусного капсида различаются и коррелируют с размером упакованных геномов.
На основе этого наблюдения они предложили новый механизм модуляции давления, объясняющий, как герпесвирусы достигают баланса между удержанием и выбросом вирусного генома.