Варианты SARS-CoV-2 сохраняют способность передаваться между видами

Новое исследование показывает, что SARS-CoV-2, эволюционировавший в варианты вроде дельта и омикрон, по-прежнему обладает высокой способностью к передаче между млекопитающими.

Учёные из Рочестерского технологического института (RIT) с помощью компьютерного моделирования обнаружили, что коронавирусы используют свои спайк-белки для прикрепления к клеткам-хозяевам как у летучих мышей, так и у человека практически одинаковым способом.

Ключевые выводы исследования:

• Исследователи смоделировали взаимодействие спайк-белков различных вариантов SARS-CoV-2 с рецепторами ACE2 у человека и летучих мышей рода Rhinolophus.
• Учёные ожидали увидеть значительную адаптивную эволюцию вируса к человеку, но изменения в сайте связывания оказались минимальными.
• Это означает, что ничто существенно не мешает вирусу передаваться от человека обратно к летучим мышам.
• Поскольку летучие мыши и человек далеко отстоят друг от друга на филогенетическом древе млекопитающих, результаты предполагают широкую межвидовую заражаемость.

Методология:

Для изучения использовался метод молекулярной динамики. Он позволяет помещать белки в растворённую среду и с помощью высокопроизводительных вычислений наблюдать за движением каждого атома во времени. Этот подход дал возможность безопасно изучить вопросы, которые невозможно исследовать в традиционной лаборатории.

Исследование опубликовано в журнале Royal Society Open Science.