Библиотека 160K Natural Organism Library — кладезь новых соединений для биологических исследований
Библиотека в A*STAR, содержащая более 160 000 биологических образцов, представляет собой сокровищницу биологически активных соединений для широкого спектра применений.
160K Natural Organism Library в Биоинформатическом институте A*STAR — одна из крупнейших в мире библиотек такого рода. В криохранилищах содержится:
Коллекция также включает более 340 000 органических экстрактов (около одной пятой из них химически "отпечатаны") и 2 600 соединений, выделенных из биологических образцов.
Уникальность библиотеки — в наличии собственной платформы для открытий, которая помогает пользователям эффективно исследовать её биологические богатства с помощью:
- Обычного биологического высокопроизводительного скрининга (тестирование экстрактов и соединений на релевантных биоанализах).
- Химического скрининга.
- Геномного скрининга.
- In silico или цифрового скрининга (использует вычислительные инструменты для анализа аннотаций геномов, белков и метаболитов).
Фрэнк Айзенхабер, директор Биоинформатического института, мечтает создать in silico библиотеку в дополнение к физической, чтобы высокопроизводительный скрининг проводился не с биологическими экстрактами, а с геномами in silico.
Его видение — секвенирование всех геномов в библиотеке. Это позволит вместо трудоёмкого и дорогого скрининга сотен соединений сначала с помощью цифрового анализа геномов выявить лучших кандидатов для in vitro биологических анализов и определить оптимальные условия для этих тестов.
"Вместо биологического высокопроизводительного скрининга десятков тысяч организмов мы бы проводили целенаправленные исследования над парой пригоршней [организмов]", — говорит он.
Библиотека образована в 2014 году путём объединения нескольких коллекций природных организмов, ранее принадлежавших компаниям и государственным организациям и переданных Биоинформатическому институту A*STAR. Образцы собраны в более чем 100 странах, но сейчас акцент смещается на региональные образцы, включая проект по сбору уникальных сингапурских штаммов бактерий.
Исследователи, ищущие новые биологически активные соединения, применимые ферменты и микробы, активно пользуются библиотекой. Одна азиатская транснациональная компания недавно начала клинические испытания соединения, полученного из этой коллекции.
По словам Фрэнка Айзенхабера, материалы библиотеки привлекают не только фармацевтический сектор, но и компании, производящие продукты питания, косметику и товары для ухода. Он видит потенциальное применение даже в таких неожиданных областях, как строительство — например, для поиска соединений, способных бороться с грибковыми заражениями, поражающими здания в тропических регионах.