Новая система ADEPT для контроля экспрессии генов в микробных популяциях

Исследователи под руководством профессора Линчон Ю разработали систему ADEPT (Amplification of Dynamic gene Expression by Programmable gene Transfer) для точного регулирования экспрессии генов. Система вдохновлена работой иммунной системы и позволяет усиливать или подавлять специфические клеточные популяции в ответ на сигналы окружающей среды.

Как работает ADEPT

Система динамически контролирует поведение плазмид — небольших кольцевых молекул ДНК, используемых для создания генетических схем. Традиционно колебания числа копий плазмид в клетках приводят к нестабильной экспрессии генов.

ADEPT решает эту проблему, балансируя два процесса:

  • CRISPR-Cas-опосредованное разрезание ДНК
  • Передачу генов между клетками

Это позволяет одновременно контролировать:

  1. Число копий плазмид внутри отдельных клеток
  2. Долю клеток в популяции, несущих плазмиды

В результате достигается усиленный динамический диапазон коллективной экспрессии генов на уровне всей популяции, а не отдельных клеток.

Преимущества и применение

  • Повышенная надежность: Снижает скорость потери плазмид и метаболическую нагрузку на клетки-хозяева, что важно для биосенсоров, биопроизводства и терапевтических применений.
  • Гибкость и масштабируемость: Обеспечивает контроль экспрессии генов в целых микробных сообществах.
  • Практическая проверка: Система уже успешно протестирована на примере биосенсора для тетратионата (TTR) — диагностического маркера воспалительных заболеваний кишечника.

По словам профессора Ю, "гибкость ADEPT открывает множество возможностей" для синтетической биологии, мониторинга окружающей среды и биомедицины. Исследование опубликовано в журнале Nature Chemical Biology.