Международный атлас клеток человека публикует стратегический план и анонсирует данные по первым миллиону клеток
Консорциум «Атлас клеток человека» (Human Cell Atlas, HCA) представил стратегический план для создания всеобъемлющей карты всех клеток человека. Этот проект станет основой для углубленного понимания здоровья человека, а также для диагностики, мониторинга и лечения заболеваний.
Публикация плана в виде технического документа на сайте HCA совпала с выходом статьи-комментария в журнале Nature от организационного комитета консорциума, в которой изложены его видение и миссия.
Кроме того, консорциум объявил о скорой публикации профилей экспрессии генов для первого миллиона иммунных клеток, собранных в рамках HCA. Это шаг к первоначальной цели — собрать для первого черновика атласа не менее 30 миллионов клеток, представляющих несколько тканей и органов. Данные будут размещены в открытом онлайн-репозитории к началу ноября и станут свободно доступны для исследователей.
Эти анонсы были сделаны на второй общей встрече HCA в Институте Вейцмана в Реховоте (Израиль). Встреча знаменует годовщину консорциума и его официальный переход от фазы планирования к операционной фазе.
«Вместе мы нарисовали план. Теперь пришло время начать строить дом», — заявил Авив Регев, сопредседатель Организационного комитета HCA.
«Данные атласа, когда он будет завершен, предоставят точку входа для более глубокого изучения функций клеток и их взаимодействий... Это знание со временем окажет преобразующее влияние на научное понимание биологии человека и здоровья человека», — отметила Сара Тайхманн, второй сопредседатель комитета.
Глобальный стратегический план
HCA, запущенный в 2016 году, ставит целью создать справочный каталог всех человеческих клеток, их пропорций, местоположения и взаимодействий. В техническом документе указано, что для первого черновика атласа консорциум изучит и картирует от 30 до 100 миллионов клеток из выбранных органов и тканей, используя:
- Массово-параллельное секвенирование РНК единичных клеток (single-cell RNA sequencing) для определения профилей экспрессии генов.
- Смежные технологии для характеристики других молекул.
- Пространственные методы для картирования локализации и взаимодействий клеток.
Долгосрочная цель консорциума — профилировать не менее 10 миллиардов клеток, охватывающих все ткани, органы и системы, включая как здоровые ткани, так и ткани, пораженные определенными заболеваниями. Полный атлас будет максимально разнообразным, учитывая различные заболевания, географические локации, среды и возрастные группы.
Управление и данные
В документе также изложены организационная структура и принципы управления консорциумом, с особым акцентом на научное разнообразие и инклюзивность. HCA управляется Организационным комитетом (OC) из 27 ученых из 10 стран.
Данные по первому миллиону клеток, которые будут опубликованы в ноябре, включают профили экспрессии РНК единичных клеток, собранных из костного мозга и пуповинной крови здоровых доноров.
Открытый доступ к данным и соблюдение ключевых этических принципов являются одними из основных ценностей HCA.