BANKSY: новый ИИ-инструмент для быстрого и точного анализа тканей

Ученые из Института генома Сингапура (GIS) и Института биоинформатики (BII) A*STAR разработали новый ИИ-инструмент «BANKSY». Он автоматически распознает типы клеток в ткани (например, мышечные, нервные, жировые), учитывая не только молекулярный профиль клеток, но и их микроокружение в ткани.

Преимущества и возможности

• Точность: Выявляет тонкие различия между группами клеток и разграничивает функциональные области в тканях (например, слои в переднем мозге человека).
• Скорость и масштабируемость: Анализирует наборы данных с более чем 2 млн клеток, работая в 10–1000 раз быстрее и в 2–60 раз эффективнее по масштабируемости, чем аналоги.
• Универсальность: Анализирует пространственные омиксные данные как на основе РНК, так и на основе белков. Может использоваться для контроля качества и объединения данных от разных пациентов.

Значение для науки и медицины

Инструмент поможет быстрее и точнее понять процессы в тканях при различных заболеваниях, что критически важно для:

• Разработки более эффективных методов диагностики и лечения рака, неврологических расстройств и других патологий.
• Открытия новых лекарств. Например, BANKSY уже используется для идентификации клеток, способствующих росту и метастазированию опухолей.

Признание

Два независимых исследования признали BANKSY лучшим алгоритмом для анализа пространственных омиксных данных. Работа опубликована в журнале Nature Genetics.