Белок hnRNPM защищает точность синтеза белков в клетках
Исследователи из Медицинского колледжа Бейлора и других институтов обнаружили, что белок hnRNPM защищает целостность процесса синтеза белков в клетках. Он предотвращает ошибки при сборке различных компонентов, ведущих к образованию новых белков.
В раковых клетках потеря hnRNPM запускает интерфероновый иммунный ответ, что указывает на клинический потенциал этого белка. Результаты опубликованы в Molecular Cell.
Как hnRNPM предотвращает ошибки сплайсинга
Синтез белка начинается с транскрипции ДНК в пре-мРНК, которая содержит кодирующие участки (экзоны) и некодирующие (интроны). Для создания функциональной мРНК интроны удаляются, а экзоны сшиваются вместе в процессе сплайсинга.
Проблема в том, что длинные интроны содержат множество псевдосплайс-сайтов — участков, очень похожих на правильные сайты сплайсинга. Если во время синтеза белка будут использованы эти псевдосайты вместо правильных, произойдет криптический сплайсинг. Это приведет к образованию мРНК с ошибочными инструкциями, что может нарушить работу клетки и вызвать болезнь.
Исследователи разработали биоинформатический пайплайн для анализа наборов данных РНК-последовательностей и обнаружили, что белок hnRNPM отвечает за точность процесса. Он предпочтительно связывается с интронами в областях, содержащих псевдосплайс-сайты.
«Связывание hnRNPM предотвращает использование этих ложных сайтов при синтезе РНК, тем самым поддерживая целостность процесса», — объяснила первый автор работы, доктор Ронг Чжэн.
Связь с иммунным ответом и онкологией
Команда также выяснила, что в отсутствие hnRNPM криптический сплайсинг может приводить к образованию двуцепочечной РНК (дцРНК), которая, как известно, запускает интерфероновый иммунный ответ.
«Опухоли с низким уровнем hnRNPM демонстрируют повышенный криптический сплайсинг, интерфероновый ответ и иммунную инфильтрацию», — отметил соавтор работы доктор Чонхуэй Ченг.
Это открытие предполагает, что ингибирование hnRNPM или усиление сплайсинга криптических экзонов, образующих дцРНК, может стать инновационным методом для активации иммунитета у пациентов с раком.