BGI разработала метод RNA-Seq (Quantification) для образцов РНК от 100 нг

Пекинский институт геномики (BGI) сообщил об оптимизации протокола построения библиотек для RNA-Seq (Quantification), требующего всего 100 нг общей РНК на входе. Этот прорыв позволяет применять технологию RNA-Seq (Quantification) в экспериментах с образцами, полученными из малого числа клеток, что широко используется в фармацевтических исследованиях, онкологии и иммунологии.

RNA-Seq (Quantification) — это вариант секвенирования нового поколения (NGS), используемый для количественного анализа транскриптома и экспрессии генов в определённых условиях. Технология находит применение в обнаружении биомаркеров, фундаментальных медицинских исследованиях и разработке лекарств. По сравнению с микрочипами, высокопроизводительное РНК-секвенирование обеспечивает всестороннюю оценку профилей экспрессии РНК с преимуществами высокой пропускной способности данных, низкого фона, высокой чувствительности и воспроизводимости.

Ранее для RNA-Seq (Quantification) требовалось 1 мкг или более общей РНК, что было затруднительно для некоторых тканей или культур специализированных клеток в клинических и фармацевтических исследованиях. BGI оптимизировала процедуры, позволив использовать всего 100 нг общей РНК для получения высококачественных данных.

«Усовершенствование RNA-Seq (Quantification) не только упрощает подготовку образцов, но и делает эту услугу секвенирования более экономичной и быстрой», — заявил Цзюн Чжан, технический специалист BGI.

Для обеспечения точности и качества данных в BGI провели множество оценок, включая качество ридов, случайность распределения чтений, покрытие генов, воспроизводимость эксперимента и точность данных. Результаты показали, что данные, полученные из библиотеки, построенной на 100 нг РНК, были такого же высокого качества, как и из традиционной библиотеки на 1 мкг.

«Я надеюсь, что наша усовершенствованная техника сможет внести больший вклад в открытие лекарств и терапевтическое применение в будущем», — добавил Чжан.