Новый метод биотипирования выявил скрытое разнообразие в британской коллекции водорослей

Тысячи образцов в британской «коллекции водорослей» потребуют перемаркировки, поскольку новаторский инструмент скрининга выявил в собрании большее разнообразие, чем считалось ранее.

Проанализировав белковый «отпечаток» 32 водорослей, которые ранее были каталогизированы под одним названием, эксперты из Университета Ньюкасла и Шотландской ассоциации морских наук (SAMS) обнаружили, что они делятся на четыре различные подгруппы, причём одна из них, по-видимому, является совершенно новым видом.

Теперь учёные из Культурной коллекции водорослей и простейших (CCAP) в Обан, Шотландия, готовятся приступить к масштабной задаче по анализу и перемаркировке коллекции, насчитывающей около 3000 образцов, в свете нового исследования, опубликованного в этом месяце в академическом журнале Scientific Reports.

Доктор Гэри Колдуэлл, старший преподаватель морских наук и технологий в Университете Ньюкасла, заявил: «Мы только начинаем понимать огромный нераскрытый потенциал водорослей как источника энергии, инструмента для очистки и в качестве пищи. И отчасти причина этого в том, что мы всё ещё относительно мало о них знаем. Правильная идентификация и категоризация различных штаммов — ключевой шаг к раскрытию этого потенциала, и именно поэтому подобные исследования так важны».

Использование морских и водных организмов для биотехнологических применений — так называемая «синяя биотехнология» — вышло на передний план глобальной исследовательской повестки за последнее десятилетие. Водоросли и цианобактерии продемонстрировали огромный потенциал — их способность преобразовывать солнечный свет в биомассу, возможность роста в солёной или гиперсолёной среде и способность метаболизировать промышленные и бытовые отходы (включая CO₂ и сточные воды) делают их привлекательными целями для промышленности.

Профессор Джон Дэй из SAMS заявил, что новый инструмент скрининга обладает «огромным потенциалом» и может привести к открытию учёными новых высокоценных химических веществ и токсинов, которые могли остаться незамеченными. Он добавил: «Наше понимание биоразнообразия в CCAP и взаимосвязи организмов друг с другом очень динамично, поэтому мы постоянно узнаём больше об этих штаммах. Этот метод «отпечатков пальцев» даст нам гораздо более точную идентификацию и даже расскажет, откуда произошли эти штаммы, с точки зрения семейных связей. Он может показать, что делает клетка и из чего она состоит».

Финансируемая Советом по исследованиям природной среды (NERC), CCAP является национальным ресурсом — водорослевым эквивалентом Миллениумского банка семян в Кью.

Используя протеомное биотипирование — быстрый и точный метод разделения штаммов — исследовательская группа проанализировала 32 водоросли, которые ранее были помечены как одинаковые на основе ключевых маркеров ДНК и физических характеристик.