Новое фундаментальное понимание борьбы с бактериями

Ученые из Лейдена выяснили, как белок H-NS позволяет кишечной бактерии E. coli адаптироваться к изменениям окружающей среды. Это новое знание может стать важной отправной точкой в борьбе с бактериями и такими заболеваниями, как перитонит. Публикация 2 октября в журнале eLife.

Белок H-NS может включать и выключать гены бактерии. Это позволяет ей выживать при изменениях в окружающей среде, например, при повышении или понижении температуры. Рамон ван дер Валк из Лейденского института химии обнаружил, как именно работает этот процесс. Это знание может лечь в основу разработки новых антибиотиков для борьбы с бактерией E. coli и другими.

H-NS сам обнаруживает изменения в окружающей среде

«Еще в 2000 году мой коллега Ремус Дам обнаружил, как белок H-NS выключает определенные гены в бактерии E. coli, — объяснил Ван дер Валк. — Но мы не знали, как эти гены можно снова включить. Теперь выяснилось, что H-NS получает сигналы из окружающей среды об изменениях и в ответ на это снова включает гены».

Благодаря работе Ван дер Валка и его коллег этот процесс теперь изучен. Оказалось, что H-NS сам способен обнаруживать изменения, включая изменения температуры и содержания натрия.

Исследование было партнерством между университетами Лейдена, Амстердама и Гейдельберга (Германия). Ученые использовали междисциплинарный подход, чтобы изучить, как работает H-NS и его реакцию на среду.

«Исследование было сосредоточено на различных сигналах из окружающей среды, на которые реагирует белок, таких как температура, pH или изменения концентрации соли. Используя биохимические и биофизические методы в сочетании с компьютерным моделированием, мы смогли проанализировать влияние этих сигналов на H-NS. В пробирке мы смогли повлиять на то, как H-NS связывается с ДНК».