Новый метод анализа ДНК в тысячу раз чувствительнее

Международная группа исследователей разработала новую технологию анализа ДНК, которая позволяет проводить надежные исследования с количествами ДНК в тысячу раз меньшими, чем было возможно ранее. Метод, названный LinDA, опубликован в журнале Nature Methods.

В чем отличие от стандартных методов

• Обычные методы (ПЦР): Усиление ДНК происходит экспоненциально (1, 2, 4, 8...), копируются как исходные, так и уже скопированные молекулы. Метод чувствителен к составу ДНК: регионы с высоким содержанием GC амплифицируются чаще, чем регионы с высоким содержанием AT.
• LinDA: Усиление ДНК происходит линейно (1, 2, 3, 4...), копируются только исходные молекулы. Ко всем молекулам ДНК в образце присоединяется специфический фрагмент на основе промотора T7 вирусного происхождения, что позволяет транскрибировать их множество раз.

Преимущества и применение

Новая технология требует ДНК всего от нескольких тысяч клеток, тогда как старым методам нужно примерно в тысячу раз больше материала. LinDA также более надежна, поскольку не имеет смещения в сторону GC-богатых регионов.

Метод можно использовать для:

• Анализа очень малых археологических образцов для определения вида животного.
• Исследования генной активности в начальных опухолях.
• Детального анализа клеток растений, вовлеченных в грибковую инфекцию, для лучшего понимания защитной системы и выведения более устойчивых сортов.