ДНК-"ископаемые" в рыбах, амфибиях и рептилиях раскрывают глубокое разнообразие ретровирусов
Ретровирусы, включая ВИЧ и другие патогены, имеют гораздо большее разнообразие, чем считалось ранее. К такому выводу пришли исследователи из Нанкинского педагогического университета (Китай), изучив эндогенные ретровирусы в геномах позвоночных.
Эндогенные ретровирусы — это генетические "ископаемые", которые образуются, когда вирусная РНК интегрируется в ДНК половой клетки хозяина и передаётся по наследству.
Метод и масштаб исследования:
- Учёные проанализировали геномы 92 видов позвоночных: 72 рыб, 4 амфибий и 16 рептилий.
- Это составляет лишь ~0.2% от разнообразия немлекопитающих и не-птиц.
Ключевые результаты:
- Было идентифицировано более 8000 эндогенных ретровирусов.
- Удалось реконструировать полные или частичные геномы для около 450 из них.
- Филогенетический анализ показал, что ретровирусы часто меняли хозяев и передавались между водными и наземными видами. Это указывает на множественное водное происхождение вирусов.
Вывод: Полученные данные значительно расширяют известное разнообразие ретровирусов. Поскольку изучена лишь малая доля видов, можно предположить, что существует огромное количество ещё не открытых ретровирусов. Их изучение поможет в прогнозировании и предотвращении будущих вспышек ретровирусных заболеваний.