В окаменевших человеческих фекалиях XIV века обнаружены гены устойчивости к антибиотикам

Французские исследователи обнаружили вирусы, содержащие гены устойчивости к антибиотикам, в окаменевшем образце фекалий из Бельгии XIV века — задолго до начала медицинского применения антибиотиков. Результаты опубликованы в журнале Applied and Environmental Microbiology.

Обнаруженные в образце вирусы — это бактериофаги, которые инфицируют бактерии, а не эукариотические организмы. Большинство вирусных последовательностей, найденных в древнем копролите (окаменевшем образце фекалий), были связаны с вирусами, которые, как известно сегодня, инфицируют бактерии, обычно встречающиеся в стуле и желудочно-кишечном тракте человека, включая как безвредные или полезные бактерии, так и патогены.

Таксономически сообщества фагов в копролите отличались от сообществ в современных образцах, но их функции, по-видимому, сохранились. Это подтверждает гипотезу о фундаментальной роли вирусного сообщества в желудочно-кишечном тракте человека, которая остаётся неизменной на протяжении веков, несмотря на изменения в диете и других условиях.

Среди генов, обнаруженных в фагах, — гены устойчивости к антибиотикам и токсичным соединениям. Поскольку токсины и антибиотики широко распространены в природе, эти гены могли защищать кишечные бактерии.

"Наши данные демонстрируют, что бактериофаги представляют собой древний резервуар генов устойчивости, существовавший как минимум со Средних веков", — отмечают авторы.

Исследование стало первым анализом древней ДНК вирусного метагенома. Для анализа вирусной фракции копролита впервые использовали комбинацию электронной микроскопии, высокопроизводительного секвенирования и "суицидальной" ПЦР.

Исследование началось после обнаружения уборных XIV века под площадью в бельгийском городе Намюр в ходе проекта по реконструкции.