Новый аналитический инструмент для флуоресцентного детектирования двуцепочечной РНК

Флуоресцентные зонды, связывающиеся с рибонуклеиновой кислотой (РНК), являются мощным и важным аналитическим инструментом для изучения структуры и функций РНК.

Исследовательская группа под руководством профессора Сэйити Нисидзавы из Высшей школы наук Университета Тохоку сообщила о новом зонде для РНК, который связывается с двуцепочечной РНК (дцРНК) специфичным к последовательности образом.

К пептидной нуклеиновой кислоте (ПНК) присоединен флуоресцентный краситель тиазоловый оранжевый (TO). При связывании с дцРНК путем образования триплекса зонд демонстрирует значительное усиление флуоресценции.

Зонд слабо реагирует на последовательности дцРНК, содержащие несовпадения, что позволяет проводить последовательностно-селективное флуоресцентное детектирование дцРНК с разрешением на уровне одной пары оснований. Он также проявляет предпочтение к связыванию с дцРНК по сравнению с двуцепочечной ДНК (дцДНК), что является важным селективным свойством для будущего применения в клеточной среде, где РНК и ДНК сосуществуют.

В отличие от традиционных аналитических методов, ограниченных одноцепочечными участками РНК, новый метод впервые позволяет проводить флуоресцентное детектирование целевой структуры и последовательности дцРНК.

Ожидается, что этот зонд откроет новые возможности для анализа функций структур, содержащих дцРНК, которые тесно связаны с различными биологическими явлениями и заболеваниями.