Расшифровка генетического кода перцев: новое исследование раскрывает детали одомашнивания и разнообразия
Международная команда исследователей, включая учёных из Boyce Thompson Institute, в исследовании, опубликованном в Nature Communications, секвенировала геномы ключевых культурных и диких видов перца. Это дало беспрецедентное понимание эволюции, одомашнивания и генетического разнообразия перцев.
Род Capsicum (перец или паприка), относящийся к семейству паслёновых, включает около 35 видов. Учёные обнаружили, что два основных одомашненных вида селекционировались по-разному, что повлияло на размер, форму и остроту плодов. Также выявлено, что некоторые виды заимствовали генетические признаки у других, что может помогать им лучше сопротивляться вредителям и стрессу окружающей среды.
Ключевые выводы исследования:
- Одомашнивание перца оказалось более сложным процессом, чем считалось ранее.
- Идентифицированы гены, связанные с критически важными признаками: форма плода, вкус и реакции на стресс.
- Обнаруженные уникальные геномные регионы могут быть использованы для создания сортов, адаптированных к специфическим условиям и с улучшенным качеством плодов.
Методология:
- Сборка высококачественных геномов для трёх видов перца с использованием современных технологий секвенирования.
- Построение комплексного графового пан-генома на их основе.
- Ресеквенирование геномов 500 разновидностей перца, охватывающих все пять одомашненных видов и их диких родственников.
- Создание детальной карты вариаций для анализа генетических различий между видами.
Как отметил один из ведущих авторов работы профессор Чжанцзюнь Фэй, исследование предоставляет ценные геномные ресурсы, углубляющие понимание генетики перца, что облегчит будущие функциональные исследования и значительно улучшит селекционные усилия.
Полученная последовательность генома перца и база данных вариантов поддерживается лабораторией Фэя и доступна для поиска, просмотра и анализа.