Генетическое исследование белков — прорыв в разработке лекарств от сложных заболеваний
Инновационное генетическое исследование уровней белков крови, проведенное учеными из MRC Integrative Epidemiology Unit (MRC-IEU) в Бристольском университете, показало, как генетические данные можно использовать для определения приоритетности мишеней для лекарств, выявляя причинно-следственные эффекты белков на заболевания.
В сотрудничестве с фармацевтическими компаниями исследователи разработали комплексный аналитический конвейер, использующий генетическое предсказание уровней белков для определения приоритетности мишеней. Они также оценили потенциал этого подхода для снижения частоты неудач в разработке лекарств.
Генетические исследования белков находятся в зачаточном состоянии. Цель этой работы, опубликованной в Nature Genetics, — установить, может ли генетическое предсказание эффектов белков-мишеней прогнозировать успех клинических испытаний препаратов. Доктор Цзе Чжэн, профессор Том Гаунт и их коллеги из Бристольского университета совместно с фармацевтическими компаниями организовали междисциплинарное сотрудничество для решения этого научного вопроса.
Используя набор методов генетической эпидемиологии, включая менделевскую рандомизацию и генетическую колокализацию, исследователи построили причинно-следственную сеть из 1002 белков плазмы и 225 заболеваний человека. В результате они выявили 111 предположительно причинных эффектов 65 белков на 52 заболевания, охватывающих широкий спектр областей медицины. Результаты исследования доступны через EpiGraphDB: http://www.epigraphdb.org/pqtl/
Ведущий автор, доктор Чжэн, заявил, что оцененные ими эффекты белков на заболевания человека можно использовать для прогнозирования эффектов лекарств, нацеленных на эти белки.
«Этот аналитический конвейер можно использовать для проверки как эффективности, так и потенциальных побочных эффектов новых мишеней для лекарств, а также для получения доказательств в пользу перепрофилирования существующих препаратов для других показаний.
Это исследование закладывает прочный методологический фундамент для будущих генетических исследований омиксных данных. Следующий шаг — использование аналитического протокола на ранних этапах валидации мишеней фармацевтическими партнерами по исследованию. Мы надеемся, что эти результаты поддержат дальнейшую разработку лекарств, повысят успешность клинических испытаний, снизят стоимость препаратов и принесут пользу пациентам», — сказал доктор Чжэн.
Том Гаунт, профессор биомедицинской информатики и здоровья Бристольского университета, добавил: «Наше исследование использовало общедоступные данные, опубликованные многими учеными по всему миру (собранные в базе данных MRC-IEU OpenGWAS), и наглядно демонстрирует потенциал открытого обмена данными для совершения новых открытий в исследованиях здоровья. Мы показали, что такое повторное использование существующих данных предлагает эффективный подход к снижению затрат на разработку лекарств с ожидаемой пользой для здоровья и общества».