Обновление генома дуриана раскрывает роль перестройки хромосом

В исследовании, опубликованном в журнале Science China Life Sciences, группа Цзянина Ю из Шэньсийского педагогического университета и группа Юйсяня Чжу из Уханьского университета собрали референсный геном дуриана размером 777.8 Mb с 28 хромосомами и 38 728 белков-кодирующими генами.

Высококачественные геномы позволили авторам реконструировать предковый кариотип из 11 протохромосом, общих для растений семейства Malvaceae, и проследить эволюционные пути формирования текущей геномной структуры. Сравнительный геномный анализ показал, что дуриан пережил событие WGT (целогеномной трипликации) примерно 20 (17–24) миллионов лет назад.

Авторы также обнаружили, что экспандированные после WGD (целогеномной дупликации) гены были значительно обогащены в модуле биосинтеза лигнина фенилпропанового пути. Это говорит о том, что недавняя WGD у дуриана могла способствовать диверсификации и специализации данного пути, важного для развития характерных плодовых шипов.

Экспансия семейств генов транскрипционных факторов, наряду с заметной активацией специфического семейства факторов теплового шока и нескольких белков теплового шока, потенциально привела к формированию у дуриана сложной и устойчивой системы, способной выдерживать экстремальные температурные условия.