Первое издание генома книжного червя: опубликован полный геном нематоды Panagrellus redivivus

Исследовательская группа под руководством профессора Вустерского политехнического института (WPI) Джейгана Шринивасана впервые полностью расшифровала генетический код свободноживущей нематоды Panagrellus redivivus, также известной как "микрочервь" или "пивной червь".

Ключевые результаты исследования

  • С помощью технологий секвенирования нового поколения учёные обнаружили в ДНК червя чуть более 24 000 предполагаемых генов — почти столько же, сколько в геноме человека.
  • Также был измерен и охарактеризован транскриптом червя — совокупность молекул РНК, транскрибированных с этих генов.
  • Это первое секвенирование свободноживущей нематоды за пределами широко изученного семейства C. elegans.
  • Результаты опубликованы в статье "Черновой геном и транскриптом Panagrellus redivivus сформированы суровыми требованиями свободноживущего образа жизни" в апрельском выпуске журнала Genetics за 2013 год.

Почему этот червь важен для науки?

  • Общий предок: Люди и нематоды имеют общего предка, жившего в океанах более 600 миллионов лет назад. Многие базовые биологические процессы у них схожи.
  • Модельный организм для изучения полов: В отличие от преимущественно гермафродитного C. elegans, P. redivivus является гонохористическим видом, то есть имеет раздельнополых особей (сацов и самок). Это делает его мощной моделью для изучения различий между полами и процессов поиска партнёра.
  • Связь с паразитами: Как свободноживущий вид, микрочервь считается предком паразитических червей. Изучение различий между ними поможет понять эволюцию паразитизма.
  • Удобство для лаборатории: Черви прозрачны, имеют короткий жизненный цикл (от эмбриона до взрослой особи за 4 дня) и легко культивируются, что идеально для генетических и нейробиологических исследований.

Неожиданные отличия от C. elegans

Анализ показал значительные различия между геномами P. redivivus и C. elegans, хотя черви внешне почти идентичны. В частности, у микрочервя, вероятно, развился большой набор генов для защиты от вирусов и патогенов, с которыми он сталкивается в окружающей среде.

Цитата Джейгана Шринивасана: "Секвенирование генома и транскриптома — важный первый шаг в том, что, как мы полагаем, станет богатой новой областью изучения фундаментальных биологических процессов, контролирующих развитие и поведение не только у червей, но и у людей".