Расшифрован геном сома обыкновенного
Международная исследовательская группа под руководством учёных из Эстонского университета естественных наук впервые отсеквенировала и собрала геном сома обыкновенного (Silurus glanis). Максимальный зарегистрированный размер этой рыбы — 5 м и до 300 кг, что делает её одним из крупнейших пресноводных видов в мире. Расшифровка генетического кода этого усатого гиганта позволит учёным лучше понять секреты его исключительно быстрого роста, огромного аппетита и долголетия.
Сом обитает в крупных европейских реках и озёрах. Он охотится в основном ночью и непривередлив в еде: в его обычный рацион входят беспозвоночные, рыба, лягушки, грызуны и птицы. В тёплой воде и при обилии пищи сом растёт чрезвычайно быстро: десятилетние особи могут достигать полутора метров в длину. Учитывая, что сом может жить до 80 лет, неудивительно, что он стал желанным трофеем и центральным персонажем многих легенд среди рыболовов.
Благодаря быстрому росту и нежному, бескостному мясу сом всё чаще используется в рекреационном рыболовстве и аквакультуре. Наибольшее количество сома вылавливается во внутренних водах России, Казахстана и Турции, а его производство в аквакультуре в настоящее время составляет около 2000 тонн в год. При этом отсутствие генетической информации сдерживало применение современных методов селекции, которые используют геномные данные вместо фенотипических признаков для оценки племенной ценности рыб.
«Собранный геном сома позволяет исследователям находить геномные области и варианты генов, влияющие на скорость роста, возраст полового созревания, устойчивость к болезням и другие важные для аквакультуры признаки», — пояснил руководитель исследования, профессор аквакультуры Эстонского университета естественных наук Рихо Гросс.
По словам участвовавшего в работе старшего научного сотрудника Эстонского университета естественных наук и профессора Шведского университета сельскохозяйственных наук Анти Васемяги, размер генома сома сравним с геномами других костистых рыб (800 миллионов пар оснований) и содержит немногим более 21 000 генов. Он добавил, что сборка генома послужит трамплином для будущих исследований, направленных на решение узких мест в аквакультуре сома и проблем, связанных с сохранением диких популяций.
