Расшифровка генома омара поможет сохранить вид

Исследователи из Университета Далхаузи и нескольких институтов США впервые опубликовали полную геномную последовательность американского омара (Homarus americanus). Это дает ключевое понимание вида, которое может улучшить устойчивость его популяции и помочь предсказать, как он отреагирует на изменение климата.

Геномная последовательность — полный список нуклеотидов, составляющих все хромосомы вида, — станет ценным ресурсом для рыболовства, экологии и биомедицинских исследований. Особенно это важно для понимания восприимчивости к болезням и способности справляться с изменениями окружающей среды.

Результаты также дадут важную информацию о биологии старения, иммунитете и обонянии существа, чья естественная продолжительность жизни оценивается в 50 или даже 100 лет. Нервная система омара является ценной моделью для изучения человеческих нейронных сетей.

Исследование, опубликованное в Science Advances, было проведено международной командой. Ученые надеются, что оно поможет выявить угрозы и в конечном итоге защитить американского омара, который поддерживает одно из крупнейших в мире промысловых ракообразных хозяйств на восточном побережье от вод Лабрадора до Нью-Джерси.

«Геном омара — это почти как энциклопедия всего, что мы могли бы изучать с точки зрения реакции омара», — говорит доктор Фрейзер Кларк.

Стресс-тесты

Команда провела стресс-тесты на омарах, а затем взяла у них образцы РНК. Полученные данные позволили проанализировать, как омары реагируют на испытания. В одном эксперименте изучали реакцию на хранение в имитированном резервуаре до четырех месяцев.

Также оценивали стресс, связанный с транспортировкой, который связывают с появлением дыр в панцире. Такие омары безопасны для еды, но менее пригодны для продажи.

«Цель использования этого инструмента — обеспечить долгосрочную жизнеспособность и устойчивость отрасли, потому что она действительно очень важна для многих небольших сообществ», — отмечает доктор Кларк.

Выявление болезней

Команда также стремилась больше узнать о болезнях, поражающих вид, особенно о панцирной болезни. Она вызывает глубокие поражения на панцире, делая его «ржавым». Эта проблема, появившаяся в 1990-х у побережья Новой Англии, нанесла ущерб прибыльной отрасли.

Ученым известно лишь, что болезнь связана с бактериями, но неясно, вызывают ли проблему сами бактерии или омар ослаблен по другой причине.

«Мы держим их в условиях, где у них есть возможность развития панцирной болезни, — говорит доктор Кларк. — И мы гораздо подробнее изучаем тех, кто заболевает, и тех, кто нет, чтобы попытаться понять, почему некоторые заболевают, а некоторые — нет».

Исследование также показало, что омар обладает надежной иммунной системой и высоким постоянством генома, поскольку ракоподобные заболевания редко регистрируются у американского омара.