Города имеют уникальные микробные «отпечатки пальцев»
Исследование показало, что города обладают собственными уникальными микробными сообществами, которые при этом мало различаются между офисами в пределах одного города. Работа, опубликованная в открытом журнале mSystems Американского общества микробиологии, проливает свет на факторы, формирующие состав микробов в искусственной среде.
Учёные из Университета Северной Аризоны (Флагстафф) взяли пробы микробов в девяти офисах трёх городов Северной Америки. Они обнаружили, что кожа человека вносит значительный вклад в микробный состав поверхностей, а полы в офисах содержат больше микробов, чем стены или потолки, вероятно, из-за почвы и других материалов, заносимых обувью.
«Мы предполагаем, что при отсутствии экстремальных условий, таких как наводнение, микробы могут пассивно накапливаться на поверхностях в искусственной среде, а не проходить активный процесс», — отметил старший автор работы, доктор философии Дж. Грегори Капорасо.
Ход исследования:
- В каждом из городов (Флагстафф, Сан-Диего, Торонто) в течение года наблюдали за тремя офисами.
- В каждом офисе установили три планшета для отбора проб (на полу, потолке и стене) с образцами окрашенного гипсокартона, потолочной плитки и ковра, а также датчиками для мониторинга влажности, освещённости, занятости и температуры.
- Пробы собирали в четыре шестинедельных периода (по одному за сезон).
- Для анализа бактериальных и грибковых сообществ использовали методы секвенирования гена 16S рРНК и ITS-1.
Ключевые выводы:
- География важнее дизайна офиса: В каждом городе сформировалось своё характерное микробное сообщество, несмотря на различия в размере офисов, режиме использования и системах вентиляции.
- Пол — самая «заселённая» поверхность: На образцах с пола (независимо от материала) микробов было больше, чем на стенах или потолках.
- Человек — важный источник: Кожа человека была крупнейшим идентифицируемым источником бактерий в офисах, внося 25–30% в микробиом поверхностей. Микробиом носа также вносил небольшой, но стабильный вклад.
- Внешняя среда — главный источник: Основная часть микробного сообщества в офисах происходила из нечеловеческих источников (например, из окружающей среды).
- Нет связи с климатом внутри помещений: Не было обнаружено значимой связи между собранными офисными микробами и такими переменными, как температура или влажность.
Интересно, что микробные сообщества в офисах Флагстаффа были богаче, чем в Сан-Диего или Торонто, хотя причина этого остаётся неясной.
В дальнейшем команда планирует смоделировать события наводнения, чтобы изучить, как со временем меняются грибковые сообщества в искусственной среде.