Бактерии и вирусы: сеть кишечных взаимоотношений

Баланс кишечной микробиоты человека, состоящей из сотен видов бактерий и бактериофагов (вирусов бактерий), имеет решающее значение для здоровья. Исследовательская группа, включая учёных из CNRS и Института Пастера, с беспрецедентной точностью охарактеризовала сети взаимодействий фагов и бактерий в микробиоте 10 здоровых людей.

Учёные обнаружили несколько сотен геномов бактерий и фагов и идентифицировали тысячи взаимодействий, связывающих их, путём количественной оценки контактов между молекулами ДНК вирусов и их хозяев. Этот метод имеет преимущество в предоставлении исчерпывающих данных из ограниченных биологических образцов.

Результаты были проанализированы с использованием алгоритмов, аналогичных применяемым для изучения сообществ в социальных сетях. Эта панорама взаимоотношений между бактериями и фагами может быть применена в терапиях, затрагивающих кишечную микробиоту, таких как трансплантация фекальной микробиоты и фаготерапия. Подход, использованный в исследовании, недавно опубликованном в eLife, также может привести к более точному анализу наземных и морских экосистем.