Геном лука наконец раскрывает свои секреты

Исследователи из Вагенингенского университета (WUR) расшифровали геном репчатого лука. Это ускорит работу селекционеров по выведению новых устойчивых сортов, способных противостоять засухе и другим условиям, и поможет удовлетворить растущий мировой спрос на лук.

"Сборка фрагментов была сложной головоломкой, — говорит исследователь в области селекции растений Ричард Финкерс. — Потому что геном лука огромен: примерно в шестнадцать раз больше, чем геном томата, и в пять раз больше, чем у человека".

Лук — одна из самых широко выращиваемых овощных культур в мире, богатая витаминами и минералами. "Чтобы производить лук по всему миру, нам нужны сорта, подходящие для различных условий выращивания, — отмечает исследователь Ольга Шолтен. — Например, нужен лук, устойчивый к различным грибковым заболеваниям, которые могут нанести ущерб и привести к значительным потерям урожая". Выведение новых сортов станет проще теперь, когда геном доступен.

Головоломка из 100 000 фрагментов

Большой размер генома сделал его расшифровку сложной задачей. "Сборка генома лука сравнима с решением пазла из 100 000 фрагментов, 95 000 из которых — просто кусочки голубого неба, — объясняет Финкерс. — Только 5000 фрагментов действительно имеют значение. Нам удалось секвенировать большую часть с помощью новейших технологий секвенирования ДНК, которые позволили собрать воедино мелкие и крупные перекрывающиеся фрагменты".

"Теперь, когда мы публикуем геном лука, другие исследователи и селекционеры смогут использовать возможности, которые предоставляет последовательность генома, — говорит Финкерс. — Это расширит базу знаний и позволит скрининг многих других сортов или диких видов на наличие определенных генов или для их комбинирования. Это можно будет включить в программу скрещивания, где полезные признаки от других сортов лука или родственных диких видов будут объединены".

Селекционеры ожидают, что доступ к последовательности генома лука удвоит скорость их селекционной работы, сократив ее в будущем примерно до шести-семи лет. "У других культур, таких как картофель и рис, роль определенных генов в обеспечении устойчивости к болезням или засухе уже тщательно изучена. Основываясь на информации о последовательности генов в этих культурах, селекционеры теперь могут легче идентифицировать похожие гены в геноме лука и точнее продвигаться в своей собственной работе".