Стартап разрабатывает ПО для анализа больших данных о микробиомах

Стартап, связанный с Университетом Пердью, разрабатывает интеллектуальную программную платформу, призванную помочь биологам использовать микробы для лечения болезней, улучшения урожаев и оздоровления скота.

Основатель компании Karyosoft Раджеш Перианайагам создал веб-решение Loci для данных микробной геномики, экономящее время и средства. Цель — помочь исследователям микробиомов быстрее «создавать изменения», освободить время биоинформатиков и повысить ценность организаций, минимизируя потерю данных.

ПО должно помочь биологам, исследующим способы использования микробов для лечения рака, диабета, болезни Крона, повышения урожайности, а также улучшения состояния крупного рогатого скота и овец.

Проблема:

• Из-за доступности дешёвых технологий секвенирования нового поколения (NGS) генерируются огромные объёмы геномных данных, что создаёт проблемы с хранением, управлением и анализом.
• Биологи часто не обладают сильными вычислительными навыками и зависят от биоинформатиков для извлечения информации из данных, что создаёт разрыв и задерживает инновации.
• Происходит потеря данных из-за неправильного хранения (на внешних дисках, флеш-накопителях и т.д.). Учёные тратят 80% времени на подготовку и организацию данных вместо открытий.

Решение Loci:

• Интервью с экспертами показали, что с подходящим ПО биологи могли бы достигать целей проекта на 25% быстрее, а биоинформатики — экономить до 50% времени.
• Loci минимизирует время подготовки данных, объединяя все геномные данные в одном месте, и сокращает потерю данных.
• Платформа помогает биологам эффективно организовывать, управлять, анализировать и визуализировать данные последовательностей микробных геномов через удобный интерфейс, напрямую соединяя их с данными.

Контекст и видение:

• Исследование микробиомов сложно из-за множества переменных. Учёные стремятся понять, как использовать эти знания для улучшения качества жизни.
• Видение Karyosoft — стать лидером в предоставлении программных решений нового поколения, упрощающих сложный анализ данных в науках о жизни.
• Ключевые отличия компании: фокус на исследованиях микробиомов (область в зачаточном состоянии) и исключительная концентрация на хранении, управлении и анализе геномных данных под задачи клиента, а не на сборке и аннотации сырых данных.