Учёные разработали новый метод измерения важной химической модификации на РНК

Исследователи, включая команду из UCLA, создали метод секвенирования РНК, который даёт детальную информацию о химической модификации m⁶A (N⁶-метиладенозин). Эта модификация играет ключевую роль в способности плюрипотентных стволовых клеток превращаться в другие типы клеток. Метод может продвинуть использование стволовых клеток в регенеративной медицине.

Исследование, опубликованное в Nature Methods, описывает технику, которая измеряет процент метилированной РНК для каждого гена в геноме.

m⁶A — наиболее распространённый тип метилирования РНК, кодирующей белки. Он регулирует срок жизни РНК в клетке и количество производимого белка. Ошибки в этих процессах могут приводить к раку и неврологическим расстройствам.

Ключевые особенности метода m⁶A-LAIC-seq:

• Ранее можно было определить только локализацию m⁶A на РНК.
• Новый метод впервые позволяет измерить количество (процент) модифицированной РНК.
• Это даёт информацию для потенциального выявления болезней, так как уровни m⁶A могут отличаться в больных и здоровых клетках.

Связь со стволовыми клетками:

Плюрипотентные стволовые клетки могут превращаться в любой специализированный тип клеток (дифференцировка) и бесконечно самовоспроизводиться. Контроль над дифференцировкой — главная задача для регенеративной медицины.

• Ранее та же группа учёных показала, что блокировка m⁶A препятствует дифференцировке стволовых клеток, сохраняя их плюрипотентность.
• Новый метод позволит глубже изучить роль m⁶A в этом процессе и улучшить контроль над стволовыми клетками в лаборатории, где они склонны к спонтанной дифференцировке.

Авторы: Со-старшие авторы — И Син (UCLA) и Космас Джаллуракис (Гарвардская медицинская школа). Первые авторы — Бенуа Молинье и Цзинькай Ван.

"Мы очень воодушевлены многообещающими данными и новым инструментом для изучения m⁶A в широком спектре клеток, включая плюрипотентные стволовые клетки", — сказал И Син.