Геном орангутана: больше разнообразия, чем у человека, и стабильность на протяжении миллионов лет

Международная команда учёных под руководством Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе секвенировала ДНК суматранского орангутана, а затем — ещё пяти суматранских и пяти борнейских орангутанов. Исследование, опубликованное 27 января в Nature, показывает глубокое генетическое разнообразие этих человекообразных обезьян.

Ключевые выводы:

• Генетическое разнообразие: Средний орангутан генетически более разнообразен, чем средний человек. Учёные каталогизировали около 13 миллионов вариаций ДНК. Это ценный ресурс для программ сохранения вида.
• Эволюционная стабильность: Геном орангутана оказался необычайно стабильным за последние 15 миллионов лет. В отличие от людей и шимпанзе, чьи геномы претерпели масштабные структурные перестройки (дупликации, делеции, инверсии), у орангутанов таких ускоренных изменений не было.
• Возможная причина стабильности: В геноме орангутана обнаружена глубокая нехватка повторяющихся элементов Alu. За 15 млн лет появилось лишь около 250 новых копий Alu, тогда как в человеческом геноме есть около 5000 человеко-специфичных копий Alu. Это может объяснить структурную стабильность.
• Сходство с человеком: Геномы человека и орангутана идентичны на 97%.
• Разделение видов: Суматранские и борнейские орангутаны разделились около 400 000 лет назад (ранее оценивалось в 1 млн лет). При этом меньшая по численности популяция суматранских орангутанов (_{7000 особей) генетически более разнообразна, чем борнейская (}50 000 особей).
• Угроза существованию: Несмотря на высокое генетическое разнообразие, будущее орангутанов в дикой природе находится под угрозой из-за продолжающегося уничтожения их среды обитания — тропических лесов, где они проводят более 95% времени.

Исследование финансировалось Национальным институтом исследования генома человека (NHGRI), Национальным научным фондом (NSF) и другими организациями.