Палеовирусология расширяется: в геномах животных найдены фрагменты неретровирусных вирусов
Новое исследование указывает путь к созданию "ископаемой летописи" вирусов, которые встроились в геномы насекомых и других животных, что может дать ключи к пониманию их эволюционной истории.
Результаты, опубликованные 18 ноября в открытом журнале PLoS Genetics, могут позволить учёным выявить общие принципы эволюции вирусов по их генетическим "окаменелостям", что, в свою очередь, может помочь в разработке подходов к контролю заболеваний.
Роберт Гиффорд (Университет Рокфеллера) и его коллега Арис Катзуракис (Оксфордский университет) использовали быстро развивающиеся технологии генетического скрининга для анализа базы данных ДНК насекомых, птиц и млекопитающих на наличие фрагментов вирусных геномов, которые они назвали эндогенными вирусными элементами (EVE). Пара обнаружила представителей десяти семейств вирусов, включая гепатит B, Эбола, бешенство, а также лихорадки денге и жёлтую, интегрированных в изученные геномы.
"В некоторых случаях мы получили первые свидетельства древнего происхождения некоторых из этих групп вирусов", — сказал Гиффорд. Хотя учёные знали о генетических следах ретровирусов в геномах животных с 1970-х годов, многое ещё предстоит узнать об этих недавно обнаруженных EVE от неретровирусных вирусов, включая точный механизм, как эти фрагменты вируса попадают в ядерную ДНК.
Большинство задокументированных Гиффордом фрагментов больше не функциональны и выглядят как так называемая "мусорная ДНК". Однако результаты предполагают, что некоторые из этих вирусных фрагментов могли быть "присвоены" своими хозяевами в какой-то момент эволюционной истории, возможно, в качестве защиты от родственных инфекций.
В частности, Гиффорд говорит, что обнаружение EVE в геномах насекомых обещает открыть новое измерение в палеовирусологии, позволяя учёным исследовать взаимосвязь и эволюцию вируса, его переносчика и хозяина, потенциально давая представление о сложных экологических отношениях, лежащих в основе болезней, переносимых насекомыми.