Выделен парвовирус из древних человеческих останков

Парвовирус человека B19, передающийся воздушно-капельным и гематогенным путём, вызывает ряд заболеваний, включая детскую сыпь (пятую болезнь), хроническую анемию у пациентов с ВИЧ, артрит у пожилых людей, апластический криз у людей с болезнями костного мозга и водянку плода у беременных. Этот одноцепочечный ДНК-вирус не имеет вакцины или лечения; терапия обычно сводится к контролю симптомов до подавления вируса иммунной системой.

Большинство доступных для исследований вирусных геномных последовательностей имеют возраст не более 50 лет. Доступ к более древним образцам мог бы дать исследователям детальное представление об исчезнувшем генетическом разнообразии и филодинамике вирусов. Международная группа учёных сообщила об анализе древних образцов парвовируса человека, взятых из зубных и скелетных останков 1578 человек, живших от 500 до 6900 лет назад. Результаты опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences.

Исследователи проанализировали данные секвенирования ДНК из древних останков людей из Евразии, Юго-Восточной Азии и Гренландии на наличие следов парвовируса человека B19. Их результаты доказывают, что возможно восстановить и секвенировать древние одноцепочечные ДНК-последовательности. Неясно, почему парвовирус сохраняется на таких огромных временных промежутках, но учёные предполагают, что его ДНК может быть защищена вирусным капсидом, самоассоциацией во время сохранения или другими механизмами.

Парвовирус человека имеет три генотипа. Из 1578 образцов исследователи обнаружили 20, соответствующих парвовирусу человека: восемь относились к генотипу один, 12 — к генотипу два, и ни один не соответствовал генотипу три. Это опровергает предыдущие предположения о том, что генотип один впервые появился после Второй мировой войны. Исследователи отмечают, что широкий спектр млекопитающих, несущих геномы, производные от парвовируса, позволяет предположить, что вирусу может быть более 12,6 тысяч лет.

Считается, что генотип два возник в результате рекомбинации генотипов один и три. На основе положения древних последовательностей исследователи смогли датировать это событие примерно 5000–6800 лет назад.

Одним из наиболее примечательных результатов стало то, что парвовирус человека, известный своей высокой скоростью эволюции, сравнимой с РНК-вирусами, на самом деле эволюционирует со скоростью примерно на порядок ниже, чем считалось ранее.

Что касается географического распространения вируса, у исследователей были ограниченные данные. Они пишут: «На основе наших данных можно предположить географическое разделение между древними последовательностями генотипа один, обнаруженными в Центральной Азии, и древними последовательностями генотипа два, обнаруженными в Европе и Гренландии». Однако они отмечают, что это может быть ошибкой выборки из-за небольшого количества положительных образцов.

В заключение они предполагают, что будущие исследования могут углубить понимание эволюционных процессов патогенов и улучшить методы филогенетического анализа.